معلومة

هل توجد قائمة بجميع الأنواع قابلة للتنزيل مع تصنيفها التقليدي؟

هل توجد قائمة بجميع الأنواع قابلة للتنزيل مع تصنيفها التقليدي؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

أبحث عن قائمة قابلة للتنزيل لجميع الأنواع المعروفة (أو الموثقة عبر الإنترنت بشكل أفضل) في هذا التنسيق المباشر ، كمثال الضفدع الأوروبي:

المملكة: Animalia
الشعبة: الحبليات
الفئة: البرمائيات
المطلوب: أنورا
العائلة: رانيدي
الجنس: رنا
الفصيلة: رنا تايماريا

أرغب في الحصول على هذه القائمة في وضع عدم الاتصال بتنسيق نص منظم أو قاعدة بيانات يمكنني تحليلها. إذا كانت هذه القائمة تحتوي على سمات مفيدة أخرى (اعتمادات ، توزيع ، أسماء شائعة) ، فهي موضع ترحيب ، ولكن ما سبق هو الحد الأدنى المطلق الذي أحتاجه. أعلم أن هناك المزيد من مستويات التصنيف في النظام أعلاه (Species 2000 & ITIS Catalog of Life: أبريل 2013) ، لكني أحتاج فقط إلى هذه المستويات الأساسية 6.

لقد كنت أبحث في عدة مجموعات وأواجه صعوبة في الحصول على البيانات التي أحتاجها. إما أن قاعدة البيانات غير مكتملة ، أو لا يمكن الوصول إليها كقاعدة بيانات ، أو بها هياكل بيانات معقدة ، أو بها واجهات برمجة تطبيقات ويب بطيئة وصفها بشكل سيئ لا يمكنني الاعتماد عليها.

من الناحية المفاهيمية ، يبدو لي أن http://www.catalogueoflife.org هو الأقرب لاحتياجاتي ، ومع ذلك فإن تنزيلهم أداة وليس قاعدة بيانات. أرى أن التنزيل يحتوي على مجلد MySQL يحتوي على الكثير من الملفات ، لكنني لا أعرف كيفية إعادة بنائه في قاعدة بيانات. يبدو أيضًا أنهم سحبوا الصفحة لوصف تنزيل قاعدة البيانات.

بقدر ما يبدو سؤالي بسيطًا (أنا لست عالم أحياء ، لذلك افترضت أنه بسيط) ، فقد أهدرت عدة ساعات في الخروج فارغًا. كنت أتساءل عما إذا كان أي شخص قد قام بالعمل لتوفير معلومات أساسية عن الأنواع بتنسيق مفهوم على النحو المطلوب؟

بالنسبة لاكتمال الأنواع ، فإن 1.3 متر من كتالوج الحياة يبدو جيدًا حقًا ، حيث إن نظامي حاليًا يعتمد على ويكيبيديا ، التي تضم 180 ألف نوع فقط.


هو

لتوسيع الإجابة منRodrigo ، يبدو أن نظام المعلومات التصنيفية المتكامل هو إجابة معقولة. يمنحك قاعدة بيانات لكل عقدة تصنيفية في Tree of Life ™ ولكل عقدة رقم تسلسلي تصنيفي (TSN). يمكنك تنزيل البيانات كقاعدة بيانات أو حتى مجرد استخدام الجداول كملفات نصية محددة بشُرط رأسية.

على سبيل المثال الملفالعاميةيخبرنا أن TSN لـ ضفدع أوروبي هو 173444. بالنظر في الملفالأسماء الطويلة، يمكننا أن نرى أن الاسم الكامل لـ 173444 هو رنا مؤقت. أخيرًا ، الملفالتسلسل الهرمي، يخبرنا أن التسلسل الهرمي الكامل لـ 173444 هو:

الضفدع الأوروبي:
→ الحيوان
→ بيلاتيريا
→ Deuterostomia
→ الحبليات
→ Vertebrata
→ Gnathostomata
→ تترابودا
→ البرمائيات
→ أنورا
→ رانيديا
→ رنا
رنا مؤقت

يمكنك تنزيل بيانات ITIS بعدة تنسيقات مختلفة من https://www.itis.gov/downloads.

بيانات نموذجية من بعض الملفات.

إذا قمت بتنزيل بيانات MySQL Tables من https://www.itis.gov/downloads/itisMySQLTables.tar.gz ، فإليك بعض الملفات المفيدة التي ستجدها.

العامية

أول حقلين منالعاميةتحتوي على TSN (الرقم التسلسلي التصنيفي) والاسم الشائع للعقدة. يتم تعيين بعض الأسماء الشائعة إلى TSN واحد وليس كل TSNs لها أسماء شائعة. بعض الأمثلة:

50 | البكتيريا | الإنجليزية | N | 2015/03/02 | 159942 14092 | الفطر | الإنجليزية | N | 2004-01-28 | 11529 14092 | فطريات المسام | الإنجليزية | N | 2004-01-28 | 11534 14092 | الصدأ | الإنجليزية | N | 2004-01-28 | 11539 183798 | قطة منزلية | الإنجليزية | N | 2007-08-15 | 111781

يمكنك قراءة الملفdropcreateloaditis.sqlلمعرفة ما تعنيه الأعمدة الأخرى.

الأسماء الطويلة

الملفالأسماء الطويلةيحتوي على حقلين فقط ، TSN والاسم "العلمي" الكامل للعنصر. على سبيل المثال:

50 | البكتيريا 14092 | Basidiomycotina 183798 | فيليس كاتوس

التسلسل الهرمي

الحقل الأول للملفالتسلسل الهرميهو التسلسل الهرمي بأكمله ، من طرف إلى آخر ، لـ TSN في الحقل الثاني ممثلاً كسلسلة من TSNs مفصولة بواصلة (-). على سبيل المثال ،

50|50|0|0|14789 555705-936287-623881|623881|936287|2|415 202423-914154-914156-158852-331030-914179-914181-179913-179916-179925-180539-552304-180580-552363-180586-183798|183798|180586|15|0

بالطبع ، يمكن البحث عن تلك TSNs في ملفالأسماء الطويلةجدول للتحويل إلى شيء يمكن للبشر قراءته. باستخدام ذلك ، هذا ما يقوله في الواقع الحقل الأول من السطر الأخير أعلاه ،

Animalia → Bilateria → Deuterostomia → Chordata → Vertebrata → Gnathostomata → Tetrapoda → Mammalia → Theria → Eutheria → Carnivora → Feliformia → Felidae → Felinae → Felis → Felis catus

Synonym_links

الsynonym_linksيحتوي الملف على قائمة TSNs المتقادمة و TSN الحالي الذي يجب أن يحل محلهما. على سبيل المثال ، TSN للغة العامية الفطر يُعطى كـ 14092 (Basidiomycotina). ومع ذلك ، فإن TSN ليس فيالتسلسل الهرميملف. بدلاً من ذلك ، تشيرنا synonym_links إلى استخدام 623881 (Basidiomycota) ، والذي يعمل. فيما يلي بعض إدخالات المرادفات:

51|50|2015-03-02 14092|623881|2004-01-28 552455|180586|2007-08-15

مثال البرنامج النصي

إذا كان لديك وصول إلى جهاز UNIX (قد يعمل MacOS) ، فيمكنك البحث عن أي اسم شائع باستخدام برنامج نصي بسيط كتبته. سيطبع تصنيفًا ، تمامًا مثل ضفدع أوروبي فوق. يمكنك قص ولصق الأوامر التالية في جهازك لتجربتها.

① قم بتنزيل البيانات

wget https://www.itis.gov/downloads/itisMySQLTables.tar.gz tar -axvf itisMySQLTables.tar.gz cd itisMySQL * /

② قم بتنزيل البرنامج النصي lookup.py الخاص بي

wget https://tinyurl.com/yyld2mm4 -O lookup.py chmod + x lookup.py

③ قم بتشغيل البرنامج النصي وإعطائه اسمًا شائعًا

./lookup.py human ./lookup.py قطة منزلية ./lookup.py حب-كذب-نزيف

④ عينة الإخراج

الإنسان: → Animalia → Bilateria → Deuterostomia → Chordata → Vertebrata → Gnathostomata → Tetrapoda → Mammalia → Theria → Eutheria → الرئيسيات → Haplorrhini → Simiiformes → Hominoidea → Hominidae → Homininae → Homo → Homo sapiens

هل جربت NCBI؟ جرب هذا الرابط:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy


أظن أنك ستكافح للعثور على ما تبحث عنه. ومع ذلك ، يمكنك تقسيم معايير البحث الخاصة بك إلى أجزاء أصغر للتوصل إلى بعض النتائج الأكثر نجاحًا (ولكن لا تزال غير مكتملة). على سبيل المثال ، أنواع ماذا؟ هل تريد حقًا جميع الأنواع (مثل البكتيريا والعتائق و Eukaryota)؟ هل تريد فقط الأنواع التي هي على قيد الحياة حاليًا (موجودة) أم جميع الأنواع التي من المعروف أنها كانت موجودة في وقت ما؟ هل تريد الأنواع الفرعية؟

بمجرد أن تقرر مثل هذه الأشياء ، قد يكون من الأفضل لك البحث عن قواعد بيانات كل دولة على حدة. إذا قررت أنك تريد جميع الأنواع ، أقترح عليك تقسيم كل بحث إلى أجزاء أصغر - مثل "الثدييات".


جرب هذا أيضًا:

http://www.catalogueoflife.org/DCA_Export/archive.php

المستند الذي يحتوي على التصنيف هو مستند taxa.txt


هل جربت ITIS؟

http://www.itis.gov/

لقد استخدمت قاعدة البيانات الخاصة بهم مرة واحدة. كان بتنسيق MS Access.

تحرير: الآن قاموا بتحديث موقعهم ، ويمكنك تنزيل PostgreSQL و MySQL و SQLite ، من بين تنسيقات أخرى: https://www.itis.gov/downloads/


ملاحظات علم الأحياء على التنوع الميكروبي | علم الاحياء المجهري

تقدم المقالة المذكورة أدناه ملاحظات حول التنوع الميكروبي.

أصبح مصطلح & # 8216 التنوع الميكروبي & # 8217 أو التنوع البيولوجي معروفًا جدًا لدرجة أن الموظف العام على دراية به أيضًا. يتم تعريف التنوع الميكروبي على أنه التباين بين الكائنات الحية. المفتاح الرئيسي للتنوع الميكروبي على الأرض يرجع إلى التطور. يمثل التنوع البنيوي والوظيفي لأي خلية حدثها التطوري الذي حدث من خلال نظرية داروين في الانتقاء الطبيعي.

الانتقاء الطبيعي والبقاء للنظرية الأصلح متورطان في الكائنات الحية الدقيقة. وهذا يشمل التنوع داخل الأنواع وبين الأنواع والنظم الإيكولوجية. تم استخدام هذا لأول مرة في عنوان اجتماع علمي في واشنطن العاصمة في عام 1986.

القائمة الحالية للتنوع البيولوجي العالمي & # 8217s غير مكتملة تمامًا (الجدول 2.1) وقائمة الفيروسات والكائنات الدقيقة واللافقاريات ناقصة بشكل خاص. يشير التنوع الفطري إلى العدد الإجمالي للأنواع في مجموعة تصنيفية معينة. تستند تقديرات 1.5 مليون نوع فطري بشكل أساسي على نسبة النباتات الوعائية من الفطريات إلى حوالي 1: 6 (الشكل 2.1).

الشكل 2.1: عدد الأنواع المعروفة من الكائنات الحية الدقيقة في العالم.

محاولات تقدير العدد الإجمالي للبكتيريا ، والعتائق ، والفيروسات أكثر إشكالية بسبب الصعوبات مثل الاكتشاف والتعافي من البيئة ، والمعرفة غير الكاملة للجمعيات الميكروبية الملزمة ، على سبيل المثال المعرفة غير الكاملة بالتعايش الحراري ، ومشكلة مفهوم الأنواع في هذه المجموعات.

خذ حالة الميكوبلازما ، وهي بدائيات النوى التي لها ارتباطات ملزمة بالكائنات حقيقية النواة ، وغالبًا ما يكون لها متطلبات غذائية تقليدية أو غير مستزرعة أو أحادية الزراعة ويبدو أنها تتمتع بتنوع ملحوظ. من ناحية أخرى ، هناك مجموعة واحدة من بلازما سبيرو ، والتي تم اكتشافها في عام 1972 ، قد تكون أكبر جنس على وجه الأرض.

ترتبط أنواع بلازما سبيرو بالحشرات بشكل أساسي وخفيف ، ويشير المعدل العام لعزل الأنواع الجديدة من هذه المصادر والبالغ 6٪ سنويًا إلى ثراء الأنواع. وبالمثل ، من المحتمل أن تدعم النظم الإيكولوجية البحرية تنوعًا ميكروبيًا غنيًا. علاوة على ذلك ، يمكن رؤية التنوع الميكروبي في حجم الخلية ، والتشكل ، والتمثيل الغذائي ، والحركة ، وانقسام الخلايا ، وعلم الأحياء التطوري ، والتكيف مع الظروف القاسية ، إلخ.

لذلك ، يبدو التنوع الميكروبي إلى حد كبير ليعكس الارتباطات الملزمة أو الاختيارية مع الكائنات الحية الأعلى ويتم تحديده من خلال التنوع الزماني المكاني لمضيفيهم أو شركائهم.

1. الكشف عن التنوع الميكروبي:

يتم تغيير مفهوم التنوع الميكروبي بشكل جذري من خلال تقنيات الحمض النووي مثل تهجين الحمض النووي والحمض النووي ، وبصمات الحمض النووي وطرق تقييم نتائج فحص الحمض النووي ، وربما الأهم في الوقت الحالي ، هو تسلسل الرنا الريباسي 16S.

لقد غيّر الرنا الريباسي 16S بشكل جذري تصنيف الميكروبات إلى 3 مجالات ، البكتيريا والعتائق وحقيقيات النوى. في حين أن التحليل المعتمد على الحمض النووي (بصمة الحمض النووي عن طريق تقييد طول الشظية والبوليمرات ، أي تحليل RFLP) هو أسلوب آخر مقبول لتقييم إعادة العلاقات بين الكائنات الحية ، خاصة إذا كانت مرتبطة ارتباطًا وثيقًا. اكتشف Holben (1988) Brady-rhizobium japonicum انتقائيًا بكثافة منخفضة تصل إلى 4.3 × 10 3 كائنات حية / جرام من التربة الجافة.

2. مفهوم الأنواع الميكروبية:

يتطور التنوع البيولوجي أو التنوع البيولوجي في الواقع كجزء من تطور الكائنات الحية ، وأصغر وحدة للتنوع الميكروبي هي الأنواع. تُعرَّف البكتيريا ، بسبب الافتقار إلى النشاط الجنسي ، والسجلات الأحفورية ، وما إلى ذلك ، على أنها مجموعة من السلالات المتشابهة المتميزة بشكل كافٍ عن مجموعات السلالات المماثلة الأخرى من خلال الخصائص الجينية ، والظاهرية ، والبيئية.

أوصت اللجنة المخصصة (التوفيق بين نهج اللجنة الدولية لعلم الجراثيم النظامي (ICSB)) في عام 1987 بأن الأنواع البكتيرية ستشمل سلالات بها ما يقرب من 70 ٪ أو أكثر من الحمض النووي المرتبط بالحمض النووي وبنسبة 5 ٪ أو أقل في الاستقرار الحراري.

ومن ثم ، فإن الأنواع البكتيرية هي نوع جيني يعتمد على ارتباط الحمض النووي DNA والمفهوم الحديث للأنواع البكتيرية يختلف عن تلك الموجودة في الكائنات الحية الأخرى. حتى الآن ، تم وصف أكثر من 69000 نوع في 5100 جنس من الفطريات وحوالي 4،760 نوعًا من حوالي 700 جنس من البكتيريا في الأدبيات على النحو الوارد في الجدول 2.1.

3. أهمية دراسة التنوع الميكروبي:

وفقًا لما نقلته الجمعية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة تحت أولوية أبحاث التنوع الميكروبي ، & # 8220 التنوع الميكروبي يشمل طيف التباين بين جميع أنواع الكائنات الحية الدقيقة في العالم الطبيعي وكما تغير بالتدخل البشري & # 8221. دور الكائنات الحية الدقيقة على الأرض والمياه على حد سواء ، بما في ذلك كونها المستعمر الأول ، له تأثيرات مخففة للبيئات المضطربة التي تحدث بشكل طبيعي والتي من صنع الإنسان.

تشير الأدلة الحالية إلى أنه ربما يوجد 3 إلى 10 أنواع من بدائيات النوى على الأرض ، ولكن تم وصف 3100 بكتيريا فقط في Bergey & # 8217s Manual. مطلوب المزيد والمزيد من المعلومات & # 8217s وستكون ذات قيمة لأن الكائنات الحية الدقيقة هي مصادر مهمة للمعرفة حول استراتيجيات وحدود الحياة.

هناك موارد للجينات والكائنات الجديدة ذات القيمة للتكنولوجيا الحيوية ، وهناك أنماط متنوعة يمكن استخدامها لرصد والتنبؤ بالتغير البيئي. تلعب الكائنات الدقيقة دورًا في بيولوجيا الحفظ والاستعادة للكائنات الحية الأعلى. تعد المجتمعات الميكروبية نموذجًا ممتازًا لفهم التفاعلات البيولوجية والتاريخ التطوري.

الأساليب الميكروبيولوجية الجزيئية التي تنطوي على تهجين DNA-DNA وتسلسل 16S rRNA ، وما إلى ذلك الآن أكثر فائدة في إنشاء التنوع الميكروبي. أصبحت قواعد البيانات متاحة على نطاق أوسع كمصدر للمعلومات الجزيئية والجزيئية الكبيرة عن الكائنات الحية الدقيقة. يتم تطوير تقنيات جديدة تعتمد على كائنات متنوعة من التشخيص إلى المستشعرات الحيوية والمحفزات الحيوية.

في تسعينيات القرن الماضي و # 8217 ، انفجر التنوع الميكروبي إلى الأمام بشكل جديد ومثير بسبب جهود علماء الأحياء الدقيقة البيئية ، الذين أبقوا شعلة التنوع حية خلال سنوات نموذج الكائن الحي.

لقد أظهرت الثورة الجزيئية التي كانت تجتاح الميكروبيول البيئي و shyogy مدى تنوع الميكروبات حقًا. كما أطلق موجات جديدة من الإبداع في تحليل تسلسل الحمض النووي الريبي لإثبات الأنشطة الأيضية وتنظيم الجينات للميكروبات في الموقع.

قد تحدث الفوائد المربحة من خلال إثراء التنوع الميكروبي. يمكن استخدام الجينومات الميكروبية لتكنولوجيا الحمض النووي المؤتلف والهندسة الوراثية للكائنات مع التطبيقات المتعلقة بالبيئة والطاقة. أصبح ظهور مسببات الأمراض البشرية الجديدة مثل السارس مهمًا جدًا نظرًا لتهديد الصحة العامة يمكن حله من خلال تحليل جينومات هذا العامل الممرض.

يمكن للمجموعات المستنبتة أن تلعب دورًا حيويًا في الحفاظ على التنوع الجيني للكائنات الحية الدقيقة. يمكن إيداع المعلومات الميكروبية & # 8217s بما في ذلك المعلومات الجزيئية والظاهرية والكيميائية والتصنيفية والاستقلابية والبيئية في قواعد البيانات. قد يؤدي عدد كبير من الكائنات الدقيقة غير المستكشفة إلى معلومات مفيدة & # 8217s.

يمكن تعزيز هذا بشكل أكبر من خلال المشاركة متعددة التخصصات للخبراء. هناك حاجة ملحة لاكتشاف وتحديد عوامل المكافحة الحيوية الميكروبية ، وتقييم فعاليتها وما إلى ذلك.

تعد الطبيعة الجزيئية والجينية لجينومات بعض مسببات الأمراض المهمة ضرورية لفهم التسبب في التلوث والتحكم الحيوي والمعالجة الحيوية للتلوث وما إلى ذلك ، إلى جانب المساعدة في الكشف والتشخيص السريع والتشخيص وتحديد الجينات لنقل الخصائص المرغوبة.

الكائنات الحية الدقيقة هي مؤشرات حساسة للجودة البيئية والحيوية. وبالتالي ، قد يكون التنوع الميكروبي مفيدًا في تحديد الحالة البيئية والحالة الخجولة لموئل معين من النظام البيئي. يمكن للكائنات الدقيقة المتنوعة أن تسبب المرض ويمكن استخدامها كأسلحة بيولوجية وشيونات. يمكن أن تساعد معرفة ما يحتمل وجوده في التشخيص والعلاج السريع.

من المحتمل أن يكون التحلل البيولوجي والمعالجة الحيوية مهمين لتنظيف وتدمير المواد غير المرغوب فيها. التنوع الميكروبي للكائنات الحية الدقيقة البحرية مهم بنفس القدر. في بعض الأحيان ، يكون من المفيد حل تلوث المأكولات البحرية والمأكولات البحرية بواسطة الكائنات الحية الدقيقة المسببة للأمراض ، على سبيل المثال المحار الملوث Vibrio vulnificus. تعتبر الطحالب الخضراء الزرقاء والياسمين من الكائنات الحية الخطرة الأخرى على صناعة تربية الأحياء المائية.

4. التطور الجرثومي:

لقد دخل التطور الميكروبي حقبة جديدة مع استخدام الأنساب الجزيئية لتحديد الترابط. من المؤكد أن هذا النوع من تحليل علم الوراثة لا يزال مثيرًا للجدل ، لكنه فتح إمكانية مقارنة الميكروبات المتنوعة للغاية بمعيار واحد ومحاولة استنتاج تاريخها.

رأى بعض العلماء أن & # 8216 فشل & # 8217 للطرق الجزيئية لإيجاد تقدم تطوري واحد لا لبس فيه من سلف واحد إلى المجموعة الحالية من الكائنات الحية الدقيقة.

إن التقدير المتزايد لوجود وتواتر أحداث نقل الجينات يفتح إمكانية تعلم بدائيات النوى الأساسية تمامًا عن طريق إنشاء نواة مركزية من الجينات التي لم تشارك في العربدة العامة لنقل الجينات. قد يساهم العدد المتزايد من سلاسل الجينوم أيضًا في فهم أفضل للتاريخ التطوري للميكروبات.


أدى تطور الحياة على الأرض على مدى الأربعة مليارات سنة الماضية إلى تنوع هائل في الأنواع. لأكثر من 2000 عام ، حاول البشر تصنيف التنوع الكبير في الحياة. يسمى علم تصنيف الكائنات الحية التصنيف. التصنيف خطوة مهمة في فهم التنوع الحالي والتاريخ التطوري السابق للحياة على الأرض.

جميع أنظمة التصنيف الحديثة لها جذورها في تصنيف ليني النظام. تم تطويره من قبل عالم النبات السويدي كارولوس لينيوس في القرن الثامن عشر. حاول تصنيف جميع الكائنات الحية التي كانت معروفة في عصره. قام بتجميع الكائنات الحية التي تشترك في سمات جسدية واضحة ، مثل عدد الأرجل أو شكل الأوراق. لمساهمته ، يُعرف Linnaeus باسم & ldquofather of التصنيف. & rdquo يمكنك معرفة المزيد عن Linnaeus ونظام التصنيف الخاص به من خلال مشاهدة الفيديو على هذا الرابط: http://teachertube.com/viewVideo.php؟video_id=169889.

يتكون نظام تصنيف Linnaean من تسلسل هرمي للتجمعات يسمى الأصناف(مفرد ، أصنوف). تتراوح الأصناف من المملكة إلى الأنواع (انظر شكل أدناه). ال مملكة هو التجمع الأكبر والأكثر شمولاً. يتكون من كائنات حية تشترك في بعض أوجه التشابه الأساسية. ومن الأمثلة الممالك النباتية والحيوانية. ال محيط هو التجمع الأصغر والأكثر تميزًا. يتكون من كائنات حية متشابهة بدرجة كافية لإنتاج ذرية خصبة معًا. يتم تجميع الأنواع وثيقة الصلة معًا في أ جنس.

نظام تصنيف ليني: تصنيف الأنواع البشرية. يوضح هذا الرسم البياني تصنيفات نظام تصنيف Linnaean. كل تصنيف هو تقسيم فرعي للصنف الموجود أسفله في الرسم البياني. على سبيل المثال ، النوع هو تقسيم فرعي للجنس. تم تصنيف تصنيف البشر في الرسم البياني كمثال.

التسميات ذات الحدين

ربما كانت أكبر مساهمة قدمها لينيوس في العلم هي طريقته في تسمية الأنواع. هذه الطريقة تسمى التسميات ذات الحدين، يعطي كل نوع اسمًا لاتينيًا فريدًا من كلمتين يتكون من اسم الجنس واسم الأنواع. مثال الانسان العاقل، الاسم اللاتيني المكون من كلمتين للإنسان. إنها تعني حرفياً & ldquowise الإنسان. & rdquo هذه إشارة إلى أدمغتنا الكبيرة.

لماذا وجود اسمين مهم جدا؟ إنه مشابه للأشخاص الذين لديهم الاسم الأول والأخير. قد تعرف العديد من الأشخاص بالاسم الأول مايكل ، ولكن إضافة اسم مايكل و rsquos الأخير عادةً ما يحدد من تقصده بالضبط. وبنفس الطريقة ، فإن وجود اسمين يحدد نوعًا ما بشكل فريد.

التنقيحات في تصنيف ليني

نشر لينيوس نظام التصنيف الخاص به في القرن الثامن عشر. منذ ذلك الحين ، تم اكتشاف العديد من الأنواع الجديدة. أصبحت الكيمياء الحيوية للعديد من الكائنات الحية معروفة أيضًا. في النهاية ، أدرك العلماء أن نظام التصنيف Linnaeus & rsquos بحاجة إلى مراجعة.

كان التغيير الرئيسي في نظام ليني هو إضافة تصنيف جديد يسمى المجال. أنطاق هو تصنيف أكبر وأكثر شمولاً من المملكة. يتفق معظم علماء الأحياء على وجود ثلاثة مجالات للحياة على الأرض: البكتيريا ، والعتائق ، وحقيقيات النوى (انظر شكل أدناه). تتكون كل من البكتيريا والعتائق من بدائيات النوى أحادية الخلية. تتكون حقيقيات النوى من جميع حقيقيات النوى ، من الطلائعيات وحيدة الخلية إلى البشر. يشمل هذا المجال الممالك الحيوانية (الحيوانات) ، والبلانتاي (النباتات) ، والفطريات (الفطريات) ، والبروتيستا (الطلائعيات).

تعتمد شجرة النشوء والتطور هذه على مقارنات بين متواليات قاعدة الحمض النووي الريبي الريبوزومي بين الكائنات الحية. تقسم الشجرة جميع الكائنات الحية إلى ثلاثة مجالات: البكتيريا ، والعتائق ، وحقيقيات النوى. ينتمي البشر والحيوانات الأخرى إلى مجال Eukarya. من هذه الشجرة ، يبدو أن الكائنات الحية التي تشكل المجال Eukarya قد شاركت سلفًا مشتركًا حديثًا مع العتائق أكثر من البكتيريا.


أمثلة على التصنيف

التصنيف العلمي للإنسان كالتالي:

  • اختصاص: حقيقيات النوى
  • مملكة: الحيوان
  • حق اللجوء: الحبليات
  • فصل: Mammalia
  • ترتيب: الرئيسيات
  • أسرة: Hominidae
  • جنس: وطي
  • صنف:العاقل

مثال آخر على التصنيف هو الرسم البياني أدناه ، والذي يوضح تصنيف الثعلب الأحمر ، الثعالب (أحيانًا تكون أسماء الأنواع والأنواع متشابهة ، على الرغم من أن هاتين رتبتين مختلفتين).


يمكن استخدام العديد من أجهزة الذاكرة لتذكر ترتيب التسلسل الهرمي التصنيفي ، مثل "عزيزي الملك فيليب جاء للحصول على معكرونة جيدة".


(1). كروموسوم عن بعد

Ø في الكروموسومات عن بعد ، يقع السنترومير في الطرف القريب (الطرف) من الكروموسوم.

Ø تسمى أطراف الكروموسومات بالتيلوميرات.

Ø وبالتالي ، فإن الكروموسومات عن بُعد هي كروموسومات طويلة تشبه العصي

Ø تظهر هذه الكروموسومات على شكل هيكل على شكل حرف "i" في مرحلة الطور الطوري لدورة الخلية.

Ø هذا النوع من الكروموسوم له ذراع كروموسومي واحد فقط.

Ø نادر الحدوث في الكروموسومات عن بعد ولم يتم الإبلاغ عنها إلا في عدد قليل جدًا من الأنواع.

(2). أكروسنتريك

Ø يتم وضع السنترومير في أحد طرفي الكروموسوم بطريقة تنتج ذراعًا قصيرًا جدًا (p) وذراعًا طويلًا بشكل استثنائي (q).

Ø تظهر الكروموسومات Acrocentric على شكل "J" في مرحلة الطور من دورة الخلية.

Ø المجموعة Acrididae (الجنادب) يظهر هذا النوع من الكروموسومات.

Ø مشتق الاسم من Acrididae (فصيلة الجنادب).

Ø جميع الكروموسومات acrocentric ستكون كروموسومات سات.

Ø كروموسوم سات = كروموسوم مع انقباض ثانوي وبنية تشبه المقبض في أحد طرفيه.

Ø في الإنسان ، الكروموسوم رقم 13 و 15 و 21 و 22 عبارة عن كروموسومات ساتية مركزية.

(3). مترابط فرعي

Ø يقع السنترومير بالقرب من مركز الكروموسوم (ليس في المركز الدقيق).

Ø وبالتالي ، فإن هذه الكروموسومات سيكون لها ذراعين غير متكافئينص"- ذراع وذراع كبير" q ".

Ø تظهر الكروموسومات شبه المترية على أنهاإل"الهياكل المتشكلة في المرحلة الأولية لانقسام الخلية.

Ø غالبية الكروموسومات البشرية هي صبغيات فرعية.

(4). ميتاسينتري

Ø يقع السنترومير بالضبط في مركز الكروموسوم.

Ø وبالتالي ، سيكون لهذه الكروموسومات ذراعان متساويان الحجم.

Ø ستظهر الكروموسومات المترية على شكل بُنى على شكل "V" في مرحلة الطور الرئيسي لانقسام الخلية.

Ø تعتبر الكروموسومات المترامية نوعًا بدائيًا من الكروموسوم.

Ø يظهر الكائن البدائي النمط النووي مع غالبية الكروموسومات في الأشكال المترية.


التصنيف العلمي

يشمل الترتيب العلمي الرئيسيات حوالي 233 نوعًا حيًا مصنفة في 13 عائلة علمية. تعيش معظم الرئيسيات في الغابات الاستوائية وتتنوع بشكل كبير في الحجم. أصغر عضو رئيسي هو الفأر القزم ليمور (Microcebus myoxinus) تزن حوالي 31 جم (1.1 أونصة) والغوريلا هي أكبر رئيسيات يصل وزنها إلى 220 كجم (484 رطلاً).

الأسرة - Hominidae

تاريخيًا ، تم تصنيف البشر وأسلافهم المنقرضين في عائلة Hominidae بينما تم تصنيف جميع القردة العليا (الشمبانزي والبونوبو والغوريلا وإنسان الغاب) في عائلة Pongidae. ومع ذلك ، فإن الأبحاث الجزيئية الحيوية والجينية جنبًا إلى جنب مع الأدلة الأحفورية الحديثة قد حددت أوجه تشابه جديدة بين الأنواع ، مما أدى إلى إعادة تصنيف الشمبانزي والغوريلا في الأسرة.

الجنس والأنواع - الغوريلا & amp beringei

في الماضي ، كان التصنيف العلمي للغوريلا يحتوي على نوع واحد (غوريلا) تم تقسيمه إلى ثلاثة أنواع فرعية. تم تمييز كل نوع من هذه الأنواع الفرعية عن بعضها البعض من خلال موقعها الجغرافي في إفريقيا.

  • غوريلا السهول الغربية (غوريلا غوريلا غوريلا) هو الأصغر من بين جميع الأنواع الفرعية الثلاثة و [مدش] يزن حوالي 180 كجم (396 رطلاً) للذكور البالغين و [مدش] ويعيش في الغابات الاستوائية في غرب إفريقيا. تتشابه غوريلا الأراضي المنخفضة بشكل عام في المظهر. غوريلا السهول الغربية هي النوع الأكثر شيوعًا من الغوريلا الموجودة في منشآت علم الحيوان وهي الأنواع التي يتم الاعتناء بها في حدائق بوش ، تامبا باي.
  • غوريلا السهول الشرقية (غوريلا غوريلا جراويري) أكبر بقليل في الحجم يصل إلى 220 كجم (484 رطلاً) وأغمق في اللون من غوريلا السهول الغربية. إنهم يعيشون في الغابات المطيرة في وسط إفريقيا.
  • غوريلا الجبل (الغوريلا الغوريلا بيرينجي) هو الأكبر والأندر من بين جميع الأنواع الفرعية الثلاثة. قد يزن الذكور البالغون أكثر من 227 كجم (500 رطل). تم العثور عليهم في ارتفاعات عالية من نطاق بركان فيرونجا الذي يفصل بين جمهورية الكونغو الديمقراطية ورواندا وأوغندا. شعرهم أطول وأغمق من نظرائهم في الأراضي المنخفضة بسبب المناخ الأكثر برودة للارتفاع العالي. الغوريلا الجبلية أطول ، ولها رأس مدبب أكثر ، ولها فجوة أوسع في منتصف الأنف ، وتفتقر إلى بقعة حمراء من الشعر على رؤوسها ، وهي شائعة في غوريلا الأراضي المنخفضة.

في عام 2001 ، أدت أبحاث الحمض النووي للميتوكوندريا والتباينات المورفولوجية إلى إعادة التصنيف العلمي للغوريلا. تحت التصنيف الجديد تنقسم الغوريلا إلى نوعين ، الغوريلا الشرقية (الغوريلا بيرينجي) والغوريلا الغربية (غوريلا الغوريلا). يُعتقد أن النوعين تباعدا عن بعضهما البعض منذ حوالي مليوني سنة وكلاهما له نوعان فرعيان.

  • نوعان فرعيان من الغوريلا الشرقية هما غوريلا الأراضي المنخفضة الشرقية (Gorilla beringei graueri) والغوريلا الجبلية (الغوريلا beringei beringi).
  • تم اقتراح وجود نوع فرعي ثالث من الغوريلا الشرقية لأن مجموعة فرعية صغيرة من الغوريلا الجبلية التي تعيش في متنزه بويندي الوطني في أوغندا تمتلك خصائص مميزة مثل التشكل والبيئة والسلوك. نظرًا لصغر حجم مجموعات الغوريلا الجبلية والعينات المتاحة للاختبار ، فمن الصعب تحديد ما إذا كانت المجموعتان مختلفتان جسديًا وجينيًا بما يكفي لاعتبارهما نوعين فرعيين منفصلين.
  • السلالتان الفرعيتان للغوريلا الغربية هما غوريلا الأراضي المنخفضة الغربية (غوريلا غوريلا غوريلا) وغوريلا كروس ريفر (غوريلا غوريلا ديلي).

التسمية

اشتق اسم "غوريلا" من رواية قديمة لمكتشف قرطاجي أبحر على طول الساحل الغربي لأفريقيا منذ ما يقرب من 2500 عام. شارك السكان المحليون أسمائهم للقرد العظيم معه و [مدش] الترجمة التقريبية التي تعني "شخص مشعر".

تعيش الغوريلا الجبلية حول سلسلة جبال فيرونجا. ترجمة فيرونجا تعني "جبل منعزل يصل إلى الغيوم".

علم تطور السلالات

يمكن تقسيم الرئيسيات إلى مجموعتين فرعيتين.

  • بروسيمي (النشطاء)
    • يقال إن البروسيميين بدائيون لأن بعض خصائصهم الفيزيائية توجد في ثدييات أخرى ولكنها عمومًا غير مشتركة في الرئيسيات الأخرى. على سبيل المثال ، يمتلك النشطاء هيكل أنف يظل رطبًا ، يُطلق عليه اسم rhinarium (يوجد أيضًا في الكلاب) ، مما يعزز حاسة الشم لديهم.
    • تنقسم الأنثروبويد إلى عالم جديد وعالم قديم. أنثروبويدس العالم الجديد موطنها أمريكا الشمالية والجنوبية بينما أنثروبويد العالم القديم موطنها أفريقيا وآسيا.
    • وتنقسم القرود كذلك إلى فئات أكبر وأخرى أصغر. تشمل القردة الصغرى 11 نوعًا معروفًا من جيبون وسيامانج موطنها جنوب شرق آسيا. القردة الكبرى موطنها الأصلي كل من إفريقيا وآسيا ، وتشمل إنسان الغاب والشمبانزي والبونوبو والغوريلا.

    تباعدت القردة عن قرود العالم القديم منذ حوالي 25 مليون سنة. هناك اختلافات كثيرة بين القردة والقرود منها الخصائص التالية:

    • القردة ليس لها ذيل
    • عادة ما يكون للقردة حجم جسم ووزن أكبر
    • تتمتع القردة بوضعية أكثر استقامة
    • القردة لها صدور أوسع
    • تعتمد القردة على الرؤية أكثر من اعتمادها على الرائحة (لها أنف عريض قصير بدلاً من أنف طويل)
    • القردة لها حمل أطول وتحتاج إلى فترات أطول لتنضج.
    • تميل القردة العليا إلى أن تكون أقل شجرية (مسكنًا للأشجار) وأكثر أرضية (مسكن أرضي). وقد أدى ذلك إلى العديد من التغييرات في الهيكل العضلي والهيكل العظمي لأذرعهم لأنها ليست مهيأة لسكن الأشجار (التأرجح بين الأشجار) مثل القرود ، ويشير سجل الحفريات إلى أن القردة الأصغر والأكبر تباعدت عن بعضها البعض حول منذ 18 مليون سنة. تباعدت عائلة Pongidae (orangutans) منذ حوالي 14 مليون سنة ، والغوريلا منذ حوالي 7 ملايين سنة ، والشمبانزي والبشر تباعدوا منذ حوالي 6 ملايين سنة.
    • البشر لديهم حوالي 98.4٪ من الحمض النووي (حمض الديوكسي ريبونوكليك - المادة الوراثية) المشتركة مع الشمبانزي. قدمت هذه المعلومات الجينية نظرة ثاقبة لعلاقة الإنسان بالقردة العليا الأخرى مثل الغوريلا. يرتبط البشر ارتباطًا وثيقًا بالشمبانزي والغوريلا أكثر من ارتباط أي منهما بإنسان الغاب.

    اكتشاف الغوريلا الحديث

    وفقًا لسجل الحفريات ، نشأت أحفاد القردة في إفريقيا منذ أكثر من 25 مليون سنة ثم انتشرت في جميع أنحاء آسيا وأوروبا.

    حدد علماء الأحافير أكثر من 15 جنسًا من القردة عاشوا خلال العصر الميوسيني (قبل 23 مليون سنة) في أماكن مثل إيطاليا واليونان.

    منذ ما يقرب من 2500 عام اكتشفت بعثة استكشافية من مدينة قرطاج التجارية الفينيقية إلى السواحل الغربية لأفريقيا بالصدفة مجموعة من الغوريلا البرية.

    خلال القرن السادس عشر ، أسر البرتغاليون بحارًا إنجليزيًا اسمه أندرو باتيل في غرب إفريقيا. تحدث عن اثنين من القردة الشبيهة بالرجال (اليوم يمكن التعرف عليها بسهولة على أنها شمبانزي وغوريلا) من شأنها أن تزور نار المخيم عندما لا تتم مراقبتها.

    تم اكتشاف الغوريلا الجبلية لأول مرة من قبل ضابط ألماني ، يُدعى الكابتن روبرت فون بيرنج في عام 1902. وقبل هذا الوقت ، كان من المعروف فقط وجود غوريلا الأراضي المنخفضة. اشتق اسم الأنواع الفرعية للغوريلا الجبلية من الاسم الأخير للكابتن روبرت فون بيرنج (Gorilla beringei beringei).

    المنظورات التطورية للغوريلا

    وصف العديد من المستكشفين القدامى والقبائل الأفريقية الغوريلا بأنها شعوب بدائية ذات شعر. كما تمت الإشارة إليها على أنها قردة بشرية أو "شبيهة بالإنسان".

    خلال القرن السابع عشر ، كان يُعرف القليل جدًا عن القرود ، وغالبًا ما كانت الأدبيات العلمية تخلط بين القردة الكبرى ورجال القبائل الأقزام.

    في عام 1860 ، وصف مستكشف يدعى Du Chaillu الغوريلا بأنها وحش غابة متعطش للدماء ومستعد لمهاجمة أي إنسان. استبعد المؤلف ألفريد بريم مطالبة دو تشيلو في كتاب عام 1876 ، Thierleben (حياة الحيوان).

    إن مظهر الغوريلا المخيف وقوتها الشديدة وعروض الضرب على الصدر أعطتهم صورة نمطية شرسة مؤسفة وغير دقيقة. أدت العديد من الأفلام السائدة إلى استمرار هذه الصورة النمطية الخاطئة ، مما أدى إلى مفاهيم خاطئة عن الطبيعة اللطيفة الحقيقية للغوريلا.

    أول بحث موثق عن الغوريلا كان في عام 1959 بواسطة جورج شالر. كان كتابه بعنوان عام الغوريلا. كان هذا من أوائل الكتب التي بددت العديد من الأساطير مثل الطبيعة الوحشية للغوريلا.

    في عام 1963 ، بدأت ديان فوسي دراستها وأبحاثها والحفاظ على الغوريلا الجبلية. في عام 1983 نشرت كتابا بعنوان الغوريلا في الضباب. في عام 1986 ، أثار فيلم مستوحى من كتابها الاهتمام العالمي بحماية الغوريلا.


    طفيليات الديدان الخيطية للحيوانات الأليفة

    مجموعة الحيواناتأنواع الديدان الخيطية
    القوارضAngiostrongylus cantonensis
    Nippostrongylus brasiliensis
    سيفاسيا أوبفيلاتا
    Capillaria hepatica
    ماشيةDictyocaulus viviparus
    Oesophagostomum radiatum
    Onchocerca gutterosa
    خيلStrongylus edentatus
    Parascaris equorum
    Oxyuris Equi
    الخنازيرستيفانوروس دنتاتوس
    اسكاريس سووم
    خروفكونتورتوس هايمونخوس
    Ostertagia ostertagi
    كلابDriofillaria spp.
    ديوكتوفيما رينال
    دجاجالقصبة الهوائية Syngamus
    اسكارديا جالي
    Heterakis gallinarum

    تشريح دودة الأرض الخارجية

    ما هو التشريح الخارجي لدودة الأرض؟

    يتكيف الجسم الخارجي لدودة الأرض جيدًا للعيش في التربة ، على غرار الهيكل الخارجي للحشرات الأخرى. يُطلق على مقدمة الدودة أو رأسها الجزء الأمامي. يحتوي الجزء الأول من الجزء الأمامي على الفم والبروستوميوم. البروستوميوم هو نوع من الشفاه يقع في مقدمة الفم. تفقد ديدان الأرض الرطوبة وتتنفس عبر جلدها. They have light-sensitive cells across their external structure, which are scattered around the skin. These cells give earthworms the ability to detect changes in lighting, and these cells are also sensitive to chemicals and touch. The body is separated in segments which resemble rings. Each segment has a number of bristly hairs attached to it, which helps the earthworm to move around. On mature earthworms, you will find a saddle or glandular ring called a clitellum. When an earthworm has mated, the clitellum will secrete a sack of eggs. The final segment of an earthworm contains the anus which is where waste is secreted.

    Dissection Guide:


    1. Put on safety goggles, gloves, and a lab apron.

    2. Place earthworm in the dissecting tray & rinse off the excess preservative. Identify the dorsal side, which is the worm’s rounded top, and the ventral side, which is its flattened bottom. Turn the worm ventral side up, as shown in the earthworm anatomy diagram below.

    3. Use a hand lens as you observe all parts of the worm, externally and internally. Locate the conspicuous clitellum, a saddle-like swelling on the dorsal surface. The clitellum produces a mucus sheath used to surround the worms during mating and is responsible for making the cocoon within which fertilized eggs are deposited. The anterior of the animal is more cylindrical than the flattened posterior and is the closest to the clitellum. The ventral surface of the earthworm is usually a lighter colour than the dorsal surface. The mouth is located on the ventral surface of the first segment while the anus is found at the end of the last segment. Find the anterior end by locating the prostomium (lip), which is a fleshy lobe that extends over the mouth. The other end of the worm’s body is the posterior end, where the anus is located.

    4. Locate the clitellum (the reproductive organ), which extends from segment 33 to segment 37. Look for the worm’s setae, which are the minute bristle-like spines located on every segment except the first and last one. Run your fingers over the ventral surface of the earthworm’s body. You should be able to feel bristle-like setae used for locomotion

    5. Refer again to the diagram of the ventral view of the worm to locate and identify the external parts of its reproductive system. Find the pair of sperm grooves that extend from the clitellum to about segment 15, where one pair of male genital pores is located. Look also for one pair of female genital pores on segment 14. There is another pair of male genital pores on about segment 26. Try to find the two pairs of openings of the seminal receptacles on segment 10. Note: These openings are not easy to see.


    A classification of living organisms

    Recent advances in biochemical and electron microscopic techniques, as well as in testing that investigates the genetic relatedness among species, have redefined previously established taxonomic relationships and have fortified support for a five-kingdom classification of living organisms. This alternative scheme is presented below and is used in the major biological articles. In it, the prokaryotic Monera continue to comprise the bacteria, although techniques in genetic homology have defined a new group of bacteria, the Archaebacteria, that some biologists believe may be as different from bacteria as bacteria are from other eukaryotic organisms. The eukaryotic kingdoms now include the Plantae, Animalia, Protista, and Fungi, or Mycota.

    The protists are predominantly unicellular, microscopic, nonvascular organisms that do not generally form tissues. Exhibiting all modes of nutrition, protists are frequently motile organisms, primarily using flagella, cilia, or pseudopodia. The fungi, also nonvascular organisms, exhibit an osmotrophic type of heterotrophic nutrition. Although the mycelium may be complex, they also exhibit only simple tissue differentiation, if any at all. Their cell walls usually contain chitin, and they commonly release spores during reproduction. The plants are multicellular, multitissued, autotrophic organisms with cellulose-containing cell walls. The vascular plants possess roots, stems, leaves, and complex reproductive organs. Their life cycle shows an alternation of generations between haploid (gametophyte) and diploid (sporophyte) generations. The animals are multicellular, multitissued, heterotrophic organisms whose cells are not surrounded by cell walls. Animals generally are independently motile, which has led to the development of organ and tissue systems. The monerans, the only prokaryotic kingdom in this classification scheme, is principally made up of the bacteria. They are generally free-living unicellular organisms that reproduce by fission. Their genetic material is concentrated in a non-membrane-bound nuclear area. Motility in bacteria is by a flagellar structure that is different from the eukaryotic flagellum. Most bacteria have an envelope that contains a unique cell wall, peptidoglycan, the chemical nature of which imparts a special staining property that is taxonomically significant (i.e., gram-positive, gram-negative, acid-fast).

    The use of “division” by botanists and “phylum” by zoologists for equivalent categories leads to a rather awkward situation in the Protista, a group of interest to both botanists and zoologists. As used below, the terms follow prevailing usage: phylum for the primarily animal-like protozoa and division for other protistan groups that are more plantlike and of interest primarily to botanists.

    The discussion above shows the difficulty involved in classification. For example, one traditional classification of the Aschelminthes, presented below and in the article aschelminth, divides the phylum Aschelminthes into five classes: Rotifera, Gastrotricha, Kinorhyncha, Nematoda, and Nematomorpha. An alternative classification elevates these classes to phyla, and still another classification establishes different relationships between the groups—phylum Gastrotricha, phylum Rotifera, phylum Nematoda (containing classes Adenophorea, Secernentea, and Nematomorpha), and phylum Introverta (containing classes Kinorhyncha, Loricifera, Priapulida, and Acanthocephala). The true relationships between these pseudocoelomates remain to be established.


    شكر وتقدير

    I thank J. Wiens for organizing the 2006 SSB symposium on species delimitation and for inviting me to contribute this paper. L. Knowles provided valuable information about methods based on coalescent theory, and J. Sites, J. Wiens, and an anonymous reviewer provided comments on an earlier version. I have previously acknowledged the contributions of numerous colleagues to the development of my views on species concepts (see de Queiroz, 1998, 1999, 2005a, 2005b, 2005c).


    شاهد الفيديو: The rise of FMCG giant Hindustan Unilever Ltd. Fundamental Analysis of HUL (قد 2022).