معلومة

هل توجد قاعدة بيانات شاملة لتقنيات / طرق علوم الحياة؟

هل توجد قاعدة بيانات شاملة لتقنيات / طرق علوم الحياة؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

هناك العديد من التقنيات / المنهجيات في علوم الحياة التي يمكننا استخدامها لطرح الأسئلة المثيرة للاهتمام. الشيء هو أن معظمنا غير مدركين تمامًا لـ متوفرة الأساليب التي يمكننا استخدامها. بدلاً من ذلك ، نتبع التقنيات المألوفة لدينا أو الشائعة في نطاقاتنا الفرعية في ذلك الوقت. لكن هذا مقيد جدًا.

لذا أتساءل ... لدينا قواعد بيانات لكل شيء آخر ... هل توجد واحدة لتقنيات / طرق علوم الحياة؟ قد يكون شيئًا كهذا مفيدًا للغاية في التخطيط التجريبي. على وجه الخصوص ، أعتقد أن قاعدة البيانات الشاملة ستساعد العلماء على الخروج من مجالات معرفتهم واستخدام أساليب أقل شهرة (ولكن يحتمل أن تكون مفيدة) لأسئلتهم.

أعلم أن هناك مجلات تنشر البروتوكولات والأساليب ، لكنها مجزأة ولا تشمل كل شيء.

هل ما أبحث عنه موجود؟ إذا لم يكن الأمر كذلك ، فكيف يمكن للمرء أن يبدأ في إنشاء مثل هذه الأداة؟


هناك Benchfly ، وهي مكتبة بروتوكول قائمة على الفيديو:

http://www.benchfly.com/video-protocols.php

هناك أيضًا JOVE ، وهي مجلة فيديو تمت مراجعتها من قبل الأقران والتي تغطي أحيانًا البروتوكولات:

http://www.jove.com/


يوجد أيضًا بروتوكول عبر الإنترنت ، ولكن بدون علامات ، يتم فرزها حسب الفئة فقط. ومع ذلك يمكن أن تكون مثيرة للاهتمام.


المفضل الشخصي لدي هو OpenWetWare. فكر في ويكيبيديا للبروتوكولات العلمية ودفتر معمل مفتوح الوصول.

هناك مشكلة في هذه الأشياء. على الرغم من الصورة النمطية الشائعة عن كون العالم منفتحًا وجيدًا في المشاركة ، فإن تجربتي هي عكس ذلك. العديد من المختبرات ليست جيدة على الإطلاق في مشاركة تقنياتها / أسرارها. سيشاركون الأشياء الأساسية التي يمكنك العثور عليها عبر الإنترنت ، لا مشكلة ، ولكن هذا يتعلق بها.

يبدو أنهم يخشون أن يكون الجميع من بعدهم ، يحاولون اغتنامهم. لقد اقترحت OpenWetWare على بعض المعامل الأخرى ورفضوا للسبب نفسه. على الرغم من أن البعض سيستخدمها للعثور على البروتوكولات ، إلا أنهم لا يرون سببًا للمشاركة مرة أخرى.


يمكنك استخدام شيء مثل https://www.synbiota.com/ حيث يمكنك تخزين البروتوكولات الخاصة بك ومشاركتها مع المتعاونين. إذا جعلت مشروعك مفتوحًا ، فيمكن لأي شخص في العالم عرض البروتوكولات الخاصة بك.

الشيء الجميل في هذا هو أنه يمكنك الرجوع إلى التجارب الفعلية التي استفادت من البروتوكول (والأدب) وهذا يعطي سياقًا وفهمًا أفضل للبروتوكولات ...


المجرة: نهج شامل لدعم البحوث الحاسوبية التي يسهل الوصول إليها والقابلة للتكرار والشفافية في علوم الحياة

لقد كشف الاعتماد المتزايد على المناهج الحسابية في علوم الحياة عن مخاوف جسيمة حول مدى إمكانية الوصول إلى النتائج المعتمدة على الحساب وقابليتها للتكرار حقًا. Galaxy http://usegalaxy.org ، منصة مفتوحة على شبكة الإنترنت للبحث الجينومي ، تعالج هذه المشكلات. يتتبع Galaxy تلقائيًا مصدر البيانات ويديره ويوفر الدعم لالتقاط سياق الأساليب الحسابية والغرض منها. Galaxy Pages عبارة عن مستندات تفاعلية تستند إلى الويب توفر للمستخدمين وسيطًا لتوصيل تحليل حسابي كامل.


جدول المحتويات

  • الفصل 1مقدمة في الأدب البيولوجي الإلكتروني
  • الفصل 3مصادر عامة
  • الفصل 4الملخصات والفهارس
  • الفصل 5الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية
  • الفصل 6البيولوجيا الجزيئية والخلوية
  • الفصل 7علم الوراثة والتكنولوجيا الحيوية وعلم الأحياء التنموي
  • الفصل 8علم الأحياء الدقيقة والمناعة
  • الفصل 9علم البيئة والتطور وسلوك الحيوان
  • الفصل 10بيولوجيا النبات
  • الفصل 11علم التشريح وعلم وظائف الأعضاء
  • الفصل الثاني عشرعلم الحشرات
  • الفصل 13علم الحيوان

كيف يعيش الجمل العربي ذو السنام الواحد دون أن يشرب؟

ألقت الأبحاث التي قادها علماء في جامعة بريستول ضوءًا جديدًا على دور كليتي الجمل العربي ذي السنام الواحد في مساعدته على التأقلم مع الظروف المتطرفة.

في ورقة جديدة نشرت اليوم في المجلة بيولوجيا الاتصالاتلقد درسوا استجابة كلى الإبل للجفاف وضغوط الإماهة السريعة.

يعتبر Camelus dromedarius أهم حيوان حيواني في المناطق القاحلة وشبه القاحلة في شمال وشرق إفريقيا وشبه الجزيرة العربية وإيران ، ولا يزال يوفر الاحتياجات الأساسية لملايين الأشخاص.

يُعتقد أنه تم تدجين الجمل منذ 3000 إلى 6000 عام في شبه الجزيرة العربية ، وقد تم استخدام الجمل كوحش ثقيل ، لركوب الخيل والرياضة ، ولإنتاج الحليب واللحوم والمأوى ، ولا تزال تستخدم حتى اليوم لنفس الأغراض .

هذا الحيوان يتكيف بشكل جيد للغاية مع البيئة الصحراوية ويمكن أن يتحمل أسابيع دون الوصول إلى الماء. الكلى المتطورة للغاية هي المفتاح لإنتاج بول عالي التركيز وضمان عدم إهدار الماء أبدًا.

في السياق الحالي للنهوض بالتصحر وتغير المناخ ، هناك اهتمام متجدد بتكيف الإبل. علاوة على ذلك ، تسمح التقنيات المختبرية المتقدمة بدراسة الآليات الجينية الكامنة وراء هذه التكيفات.

ومع ذلك ، لم تكن هناك حتى الآن ، دراسة متاحة مجانًا وشاملة للجينات المتورطة في التعامل مع الجفاف في كلية الإبل.

وُلد هذا المشروع في عام 2015 مع بداية تعاون مثمر بين معمل البروفيسور ديفيد مورفي في جامعة بريستول ومختبر البروفيسور عبده آدم في جامعة الإمارات العربية المتحدة.

حلل الفريق كيف تغيرت آلاف الجينات في كلية الإبل نتيجة الجفاف والإماهة ، واقترحوا أن كمية الكوليسترول في الكلى لها دور في عملية الحفاظ على المياه. استخدموا تقنيات مختلفة للتحقق من صحة هذه النتائج.

قال المؤلفان الرئيسيان فرناندو ألفيراي إيرايزوز وبنجامين تي جيلارد من كلية الطب بجامعة بريستول: "إن انخفاض كمية الكوليسترول في غشاء خلايا الكلى سيسهل حركة المواد المذابة والماء عبر أقسام مختلفة من الكلى - عملية مطلوبة لإعادة امتصاص الماء بكفاءة وإنتاج بول عالي التركيز ، وبالتالي تجنب فقد الماء.

"هذه ، على حد علمنا ، هي المرة الأولى التي يرتبط فيها مستوى الكوليسترول ارتباطًا مباشرًا بالحفاظ على المياه في الكلى. وبالتالي ، فإننا نصف دورًا جديدًا لهذا الدهن قد يكون مهمًا عند دراسة الأنواع الأخرى. "

يقدم الفريق أيضًا مصدرًا هائلاً للمعلومات التي ، كما ذكر أحد المراجعين ، ذات قيمة كبيرة في سياق تغير المناخ ، وبالتالي ستساعد العلماء على فهم آليات التحكم في المياه في حالة الجفاف.

بعد نشر هذا البحث ، يبحث الفريق الآن في كيفية استجابة دماغ الجمل لنفس المحفزات وكيف تتكيف الأنواع الأخرى ، مثل الفئران والجربوسة ، مع الحياة في الصحاري.


علوم الحياة

توفر اختبارات التجارب التحليلية والتحليلية الحيوية والسريرية ، جنبًا إلى جنب مع قدرات إدارة العمليات ، مجموعة واسعة من الخدمات الأساسية.

خدمات علوم الحياة من SGS - قم بتحسين الجداول الزمنية للتطوير للحصول على الأدوية والأجهزة الطبية لتسويقها بسرعة وأمان.

لا يوجد مجال عمل آخر أكثر تنظيمًا من تطوير واختبار وتوزيع الأدوية والأجهزة الطبية المنقذة للحياة. لهذا السبب نوفر لك الخبرة والموارد التي تحتاجها للتنقل في تعقيدات أسواق الأجهزة الصيدلانية والطبية.

بصفتنا الشركة الرائدة عالميًا في مجال الاختبارات والتحقق والاعتماد ، نقدم لك عقودًا من الخبرة في مجال علوم الحياة. نتيجة لذلك ، فإننا غالبًا ما نكون الشريك المفضل لأفضل 20 شركة في مجال الأدوية والتكنولوجيا الحيوية ونكون في وضع مثالي لمساعدتك:

  • احصل على منتجاتك في السوق بسرعة وأمان وبدقة أكبر
  • الالتزام بأفضل الممارسات والتوافق مع اللوائح الوطنية والدولية
  • احصل على دعم حيوي طوال كل مرحلة من مراحل دورة تطوير الدواء - من الجزيء إلى السوق. تشمل مجموعتنا الشاملة من الحلول البحث السريري ، والتوصيف ، واختبار إطلاق المنتج ، والتدقيق ، وإصدار الشهادات ، والتحقق
  • قم بالوصول إلى واحدة من أكبر شبكات المختبرات التحليلية التعاقدية في العالم ، والمزودة بعاملين وعلماء مؤهلين وذوي خبرة. نقدم لك أيضًا ثلاث وحدات من المرحلة الأولى ومكاتب لإدارة التجارب السريرية في جميع أنحاء أوروبا والولايات المتحدة.
  • استفد من معرفة الخبراء بالبيئة التنظيمية للأجهزة الطبية ، مع خدمات الشهادات والتدريب والاختبار لمساعدتك على طرح منتجاتك في السوق ، مهما كان حجم عملياتك
  • احصل على حلول الاختبار والاعتماد لمنتجات الصحة والجمال والعافية ، بما في ذلك المغذيات والمكملات الغذائية
  • تزويد موظفيك بالتدريب الفعال. تغطي خدماتنا التدريبية المجالات الرئيسية الثلاثة وهي الأدوية والأجهزة الطبية والصحة والجمال والعافية. سيتم تصميم دوراتنا وفقًا لمتطلباتك الدقيقة ويمكن عقدها في مقر عملك أو خارجيًا. حتى أننا نقدم تدريبًا قائمًا على الويب ، مما يمكّن الطلاب من أخذ الدورات التدريبية بوتيرة ووقت يناسبهم

اتصل بنا اليوم لمعرفة كيف يمكن لخدمات علوم الحياة التي نقدمها أن تساعدك في عملك.


13. جدران الكلمات

يمكن أن تحفز جدران الكلمات العلمية في الفصول الدراسية اهتمام الطلاب بالموضوع وتوفر لهم فرصة لتوضيح المفاهيم المختلفة. في تقنية متقدمة ، يمكن تحقيق فهم أعمق للمصطلحات العلمية المختلفة باستخدام الصور المصاحبة للكلمات.

هذا أيضًا خيار لمساعدتهم على فهم الكلمات ذات المعاني المتعددة بشكل أفضل. يمكن للمدرسين تصميم جدران كلمات إبداعية أو مطالبة الطلاب بالمساهمة في الفكرة أسبوعيًا أو شهريًا.


أساليب

أصل ومعالجة مكتبات PWM

تم تنزيل مصفوفات الاحتمالية الأساسية من JASPAR Core Vertebrate (2018) و HOCOMOCO Human (v11 FULL) بتنسيق قاعدة بيانات MEME من خادم ويب مجموعة MEME. تم تنزيل مصفوفات CIS-BP مباشرة من موقع الويب الأصلي. تحتوي مجموعة CIS-BP المستخدمة في هذا العمل على جميع المصفوفات التي تم استنتاجها مباشرة من التجارب مع TFs البشرية باستثناء تلك المصفوفات المستوردة من JASPAR و HOCOMOCO. تم تعيين المصفوفات يدويًا إلى رموز الجينات وعائلات TF من TFclass [29] و CIS-BP. يتم توفير التعليقات التوضيحية للمصفوفات (بما في ذلك الميزات الأساسية مثل الطول ومحتوى GC) و TFs ذات الصلة في ملف إضافي 6. تم تعديل المصفوفات الأصلية بشكل طفيف بإضافة مصطلح تصحيح قدره 0.0001 لكل عنصر مصفوفة ، متبوعًا بإعادة تسوية الموضع- توزيعات احتمالية محددة. تعمل خطوة المعالجة المسبقة هذه على منع الاستثناءات العددية بسبب لوغاريتمات 0. وبالمناسبة ، وجدنا أيضًا أنها تزيد من الأداء المعياري لجميع المصفوفات تقريبًا.

المقارنة المعيارية مع قوائم الذروة ChIP-seq

تم استخدام إصدار خاص من قوائم ذروة ReMap [25] ، والتي تضمنت درجات تخصيب الإشارة ، في هذا العمل ويمكن تنزيلها من مستودع بيانات MGA [38]. تم استخدام قوائم الذروة فقط مع ما لا يقل عن 5000 قمة. تم استخدام المعلمات التالية لقياس الأداء: عرض المنطقة ث = 250 ، عدد القمم ذات التصنيف الأعلى: ن = 2000 موقع تسلسل التحكم السلبي بالنسبة لمراكز الذروة د = + 500.

المقارنة مع بيانات HT-SELEX

تم تنزيل تسلسلات المكتبة الموصوفة في [26] و [27] من أرشيف النوكليوتيدات الأوروبي [39] بتنسيق FASTQ. تحتوي ملفات المصدر على تسلسل الحمض النووي للإدخالات العشوائية بدون رموز شريطية أو بادئات. تم تحويل ملفات FASTQ إلى تنسيق FASTA. تم الاحتفاظ فقط بالتسلسلات المكونة حصريًا من A و C و G و T والتي لها الطول المشار إليه باسم المكتبة.

لاحظ أن التسلسلات من الدراستين مستمدة من نفس سلسلة التجارب. تم تجميع المكتبات التي تمثل دورات مختلفة من نفس التجربة. ثم تم حذف التكرارات من المكتبات المجمعة (بافتراض أنها كانت نسخ PCR من جزيئات المؤسس نفسها). تم استخراج مجموعة فرعية عشوائية من مليون تسلسل من المكتبات التي تحتوي على أكثر من مليون تسلسل ، من أجل تقليل وقت الحوسبة المعيارية. كبديل لتسلسلات الإدخال (الدورة الصفرية) ، قمنا أيضًا بإنشاء تسلسلات تحكم سلبية عن طريق خلط أحادي النوكليوتيد للإدخالات ولكن مع ترك التمهيدي وتسلسل الباركود دون تغيير (انظر أدناه).

قمنا بتوسيع تسلسلات الإدراج العشوائي المتوفرة في الملفات المصدر مع التسلسلات التي كانت موجودة فعليًا أثناء تجارب الربط. وفقًا لـ [26] ، كانت متواليات التمهيدي المرافقة 5 و 3 كما يلي:

تختلف الرموز الشريطية من تجربة إلى أخرى. بعد المرافقة مع الباركود والاشعال على كلا الجانبين ، تم اقتطاع التسلسلات لتشمل فقط 20 نقطة أساس بجوار الإدخال العشوائي على كل جانب. على سبيل المثال ، تم تمديد تسلسلات الإدراج العشوائي من التجربة ELK3_TCGGG20NGGT_AG (الرموز الشريطية TCCGGGG و GGT ، كما هو موضح بالاسم) بالطريقة التالية:

نظرًا لأن الملفات المصدر التي تحتوي على قوائم ذروة ReMap ومكتبات SELEX لها أسماء مفيدة ومفهومة بشكل حدسي ، فقد تم استخدامها كمعرفات للتجربة في هذه المقالة. تم أيضًا استخراج رموز الجينات TF المخصصة لكل تجربة من أسماء الملفات المقابلة.

المقارنة المعيارية مع بيانات PBM

تم تنزيل بيانات المصفوفة الدقيقة المرتبطة بالبروتين (PBM) للإنسان والفأر من UniPROBE (Hume et al. [12]) باعتبارها "بيانات مسبار طبيعية". تحتوي ملفات كل تجربة على عمود واحد بكثافة طبيعية لكل مسبار وتسلسل المسبار الفعلي بما في ذلك تسلسل رابط ثابت. للحصول على قيم الارتباط لمدخل PWM (تم الحصول عليه من JASPAR أو HOCOMOCO أو CIS-BP ومعالجته كما هو موضح سابقًا) فيما يتعلق بكثافة السجل المقاسة ، تم التقيد بالإجراء التالي: لكل تسلسل مسبار ، كان أول 41 زوجًا أساسيًا المستخرج ، باستثناء جزء من تسلسل الرابط الثابت. ضمن هذا التسلسل ، تم تطبيق PWM في نهج النافذة المنزلقة للحصول على احتمالات لكل موضع ، والتي تم تجميعها في مجموع نقاط الإشغال ، أي سجل مجموع هذه الاحتمالات لكل تسلسل مسبار. أخيرًا ، تم الإبلاغ عن معامل ارتباط بيرسون بين درجات شغل مجموع السجل وشدة السجل كقيمة ارتباط لزوج من تجربة PWM و PBM.

توافر بروتوكول قياس الأداء

بروتوكولات قياس الأداء المستندة إلى ChIP-seq و HT-SELEX متاحة للجمهور عبر واجهة الويب على https://ccg.epfl.ch/pwmtools/. تتوفر البروتوكولات ChIP-seq و HT-SELEX المستندة إلى PBM كصور عامل إرساء من https://github.com/autosome-ru/motif_benchmarks [40].

مجموع نقاط التصنيف وتحديد أفضل مصفوفة أداء للجين

تم استخراج جميع الصفوف المقابلة لجين معين من جدول كامل يحتوي على مقاييس الأداء (ROC AUC أو معاملات الارتباط) لمجموعات التجارب (الصفوف) ومصفوفات عزر TF (الأعمدة). تم تحويل الأرقام الموجودة في صف معين أولاً إلى رتب. ثم تم حساب الأداء العام لمصفوفة لتجارب متعددة لنفس الجين على أنه المتوسط ​​الهندسي على الرتب. يشار إلى هذه الدرجة باسم "مجموع نقاط التصنيف" في مكان آخر من النص.

تجميع الحافز

لتجميع الأشكال واختيار الأشكال التمثيلية ، قمنا أولاً ببناء مصفوفة مسافة بين جميع أزواج TFs البشرية في HOCOMOCO و JASPAR ، باستخدام MacroAPE [41] لحساب مسافات Jaccard بين مجموعات الكلمات التي تم التعرف عليها بواسطة الزخارف. تم استخدام مصفوفة المسافة هذه لإنشاء شجرة هرمية باستخدام UPGMA (طريقة مجموعة الزوج غير الموزونة بمتوسط ​​حسابي). توقف تجميع الحافز عندما وصلت المسافة بين المجموعات المندمجة 0.95 أو أكثر. نتيجة لذلك ، توصلنا إلى 225 مجموعة. من كل مجموعة ، تم أخذ نموذج تمثيلي واحد عن طريق تقليل متوسط ​​المسافة إلى الزخارف الأخرى في المجموعة.

تحليل T-SNE

تم إجراء التحليل باستخدام تطبيق sklearn t-SNE [42] مع تهيئة PCA. تم استخدام تشابه جيب التمام كمعامل مسافة. تم تعيين معامل الحيرة على 25 لمعايير ChIP-seq و HT-SELEX و 55 لمعيار PBM.

تحليل الارتباط بين سمات الحافز الأساسية وقيم الأداء

تتوافق كل نقطة أساسية في مخطط الكثافة مع PWM واحد من TF معين. للتطبيع لأعداد مختلفة من مجموعات البيانات لكل TF ، تم حساب قيم AUC ROC (لـ ChIP-seq و SELEX) والارتباط (لـ PBM) عن طريق حساب متوسط ​​القيم المقابلة على جميع مجموعات البيانات لـ TF المقابلة لـ PWM قيد الدراسة. تم استخدام حزمة Python seaborn للتصور.


نقاط القوة والضعف في التصاميم المتسلسلة

في كلا النموذجين المتسلسلين الموصوفين أعلاه (استكشافي وتوضيحي) ، تم جمع البيانات وتحليلها في مرحلتين متميزتين. كما يتضح من الأمثلة من أدبيات BER ، تشمل نقاط القوة الرئيسية للتصاميم المتسلسلة القدرة على 1) وضع سياق وتعميم النتائج النوعية على عينات أكبر (في حالة الاستكشاف المتسلسل) 2) تمكن الفرد من اكتساب فهم أعمق للنتائج كشفت عنها الدراسات الكمية (في حالة التفسير المتسلسل) و 3) جمع وتحليل الطرق المختلفة بشكل منفصل. بالإضافة إلى ذلك ، فإن النهج المكون من مرحلتين يجعل التصميمات المتسلسلة سهلة التنفيذ والوصف والإبلاغ.

تتمثل إحدى نقاط الضعف في التصميمات المتسلسلة في طول الوقت المطلوب لإكمال مرحلتي جمع البيانات ، خاصة بالنظر إلى أن المرحلة الثانية غالبًا ما تكون استجابة لنتائج المرحلة الأولى. أي ، من خلال جمع البيانات في نقطتين زمنيتين مختلفتين ، يضاعف أحدهما بشكل أساسي طول الوقت المطلوب لإكمال دراسة أحادية الأسلوب. علاوة على ذلك ، نظرًا لأن جمع البيانات متسلسل ، فقد يكون من الصعب تحديد موعد الانتقال إلى المرحلة التالية. قد يكون من الصعب أيضًا دمج أو ربط نتائج المرحلتين. بالنسبة لتلك المشاريع ذات الأطول الزمنية الأقصر ، قد تكون التصميمات المتزامنة التي يتم فيها جمع مجموعتي البيانات في مرحلة واحدة أكثر ملاءمة. يقدم القسم التالي من الورقة تفاصيل عن التصاميم المتزامنة لـ MMR.


مجموعة علوم الحياة الطبية الحيوية وأمبير

أكثر من 2900 محاضرة على غرار الندوة ، تغطي الموضوعات الرئيسية من العلوم الأساسية إلى التدخل العلاجي.

تصفح المحاضرات حسب الفئة أو المجال العلاجي

وحدات الدورة الشاملة

محاضرات ومواد داعمة مناسبة لمديري الدورات والباحثين الراغبين في تقديم دورات في مواضيع متخصصة. مناسب أيضًا لمواصلة برامج التطوير المهني / التعليم.

سلسلة الفحص

تغطي كل سلسلة موضوعًا معينًا ويتم تجميعها بتوجيه من محرر خبير.
يتم تسليم المحاضرات من قبل جهات رائدة في هذا المجال.

بتكليف خاص من كبار الخبراء العالميين ، بمن فيهم الحائزون على جائزة نوبل

تغطية الأساسيات وأحدث الأبحاث والتطوير

  • من كبار الخبراءفي شكل سهل الاستعمال.
  • الوصول عبر الأنظمة الأساسيةالوصول على أجهزة الكمبيوتر الشخصية وأجهزة Mac Android و iOS.
  • أينما وجد الإنترنتفي الحرم الجامعي ، في المنزل ، عند السفر.
  • ابق على اطلاعالإصدارات الجديدة المختارة لتتناسب مع اهتماماتك.
  • الحصول على النصوص ، وتدوين الملاحظات ، وتنزيل الشرائحقم بتدوين الملاحظات وحفظها. تنزيل النصوص.
  • ما قاله الطلابعرض مجموعة مختارة من العديد من التأييدات الإيجابية التي تلقيناها.
  • من السلطات القياديةفي شكل سهل الاستعمال.
  • اجعل جزءًا من الدورة التدريبيةتضمين في Moodle أو Blackboard أو غيرها من بيئة التعلم عبر الإنترنت & ndash اجعل جزءًا من دورة أو أوصي به كمواد تعليمية إضافية.
  • يتم توسيعه وتحديثه باستمرارمحاضرات جديدة تضاف كل شهر.
  • قلب وامزجمثالي للتعلم المقلوب والمختلط.
  • مصممة لدعم التدريس والتعلممحاضرات في محاضرات مستوى الدراسات العليا المتقدمة متاحة للطلاب الجامعيين. يجعل الدورات الفردية والدورات ذات العدد الصغير ممكنة. أرسل إلينا منهجك الدراسي وسيقترح فريق الاستشاريين لدينا محاضرات ذات صلة.
  • ما قاله الآخرونعرض مجموعة مختارة من العديد من التأكيدات الإيجابية التي تلقيناها.
  • محتوى عالي الجودةفي شكل سهل الاستعمال.
  • كبار الخبراءمن الصناعة والأوساط الأكاديمية.
  • يتم توسيعه وتحديثه باستمرارمحاضرات جديدة تضاف كل شهر.
  • الوصول إلى الموقع وخارجهفي المختبر ، في المنزل ، عند السفر وندش أينما وجد الإنترنت.
  • اعتماد CME & amp CPDأكمل الاختبار & - اكسب الرصيد.
  • ما قاله الآخرونعرض مجموعة مختارة من العديد من التأكيدات الإيجابية التي تلقيناها.
  • تسجيلات ماركأعد أمناء المكتبات بدقة لأمناء المكتبات لضمان سهولة التكامل.
  • دعم الاكتشافمتوافق مع الكتالوجات وخدمات الاكتشاف الرائدة على الإنترنت.
  • الوصول إلى الموقع وخارجهفي الحرم الجامعي ، في المنزل ، عند السفر & ndash أينما يوجد الإنترنت.
  • إحصائيات الاستخداميتم توفير تقارير استخدام مفصلة لتتناسب مع متطلباتك.
  • مواد دعائيةملصقات ولافتات والمزيد & - مجموعة واسعة من المواد الترويجية الجاهزة للاستخدام.
  • ما قاله الآخرونانظر ماذا يقول المكتبيون الآخرون عنا.

ما قاله الآخرون

يوفر HSTalks الوصول إلى محاضرات عالمية المستوى من قبل كبار المسؤولين من جميع أنحاء العالم ، في مورد واحد عبر الإنترنت - في أي مكان وفي أي وقت وكلما كان ذلك مطلوبًا. يشمل مشتركونا مجموعة واسعة من الجامعات وكليات الطب وكليات إدارة الأعمال والكليات والمستشفيات والهيئات الحكومية وشركات الأدوية في جميع أنحاء العالم.


محتويات

يختلف التعريف الدقيق للتصنيف من مصدر إلى آخر ، لكن يبقى جوهر النظام: مفهوم مجموعات الكائنات الحية وتسميتها وتصنيفها. [1] كنقاط مرجعية ، ترد أدناه التعريفات الحديثة للتصنيف:

  1. نظرية وممارسة تجميع الأفراد في الأنواع ، وترتيب الأنواع في مجموعات أكبر ، وإعطاء أسماء تلك المجموعات ، وبالتالي إنتاج تصنيف. [2]
  2. مجال علمي (ومكون رئيسي في علم اللاهوت النظامي) يشمل الوصف والتعريف والتسمية والتصنيف [3]
  3. علم التصنيف ، في علم الأحياء ، ترتيب الكائنات الحية في تصنيف [4]
  4. "علم التصنيف كما هو مطبق على الكائنات الحية ، بما في ذلك دراسة وسائل تكوين الأنواع ، إلخ." [5]
  5. "تحليل خصائص الكائن لغرض التصنيف" [6]
  6. "علم اللاهوت النظامي يدرس علم التطور لتوفير نمط يمكن ترجمته إلى تصنيف وأسماء مجال التصنيف الأكثر شمولاً" (مدرج على أنه تعريف مرغوب فيه ولكنه غير معتاد) [7]

تضع التعريفات المتنوعة التصنيف كمجال فرعي لعلم اللاهوت النظامي (التعريف 2) ، أو قلب تلك العلاقة (التعريف 6) ، أو يبدو أنها تعتبر المصطلحين مترادفين. هناك بعض الخلاف حول ما إذا كانت التسمية البيولوجية تعتبر جزءًا من التصنيف (التعريفان 1 و 2) ، أو جزءًا من علم اللاهوت النظامي خارج التصنيف. [8] على سبيل المثال ، التعريف 6 مقترن بالتعريف التالي للمنهجيات التي تضع المصطلحات خارج التصنيف: [6]

  • النظاميات: "دراسة تحديد وتصنيف وتسمية الكائنات الحية ، بما في ذلك تصنيف الكائنات الحية فيما يتعلق بعلاقاتها الطبيعية ودراسة التباين وتطور الأصناف".

مجموعة كاملة من المصطلحات بما في ذلك التصنيف ، وعلم الأحياء النظامي ، والنظاميات ، وعلم النظم الحيوية ، والتصنيف العلمي ، والتصنيف البيولوجي ، وعلم الوراثة في بعض الأحيان لها معاني متداخلة - أحيانًا متشابهة ، وأحيانًا مختلفة قليلاً ، ولكنها دائمًا مرتبطة ومتقاطعة. [1] [9] يستخدم هنا المعنى الأوسع "للتصنيف". تم تقديم المصطلح نفسه في عام 1813 من قبل دي كاندول في كتابه Théorie élémentaire de la botanique. [10]

تحرير دراسة وتصنيفية

أ مراجعة التصنيف أو مراجعة تصنيفية هو تحليل جديد لأنماط التباين في تصنيف معين. يمكن تنفيذ هذا التحليل على أساس أي مجموعة من الأنواع المختلفة المتاحة من الشخصيات ، مثل الشكل المورفولوجي ، والتشريحي ، والحيوي ، والكيميائي الحيوي ، والجيني. دراسة أو مراجعة كاملة هي مراجعة شاملة لتصنيف المعلومات المقدمة في وقت معين ، وللعالم بأسره. قد يتم تقييد المراجعات (الجزئية) الأخرى بمعنى أنها قد تستخدم فقط بعض مجموعات الأحرف المتاحة أو لها نطاق مكاني محدود. ينتج عن المراجعة تشكيل أو رؤى جديدة في العلاقات بين subaxa داخل الصنف قيد الدراسة ، مما قد يؤدي إلى تغيير في تصنيف هذه subaxa ، أو تحديد subaxa جديد ، أو دمج subaxa السابق. [11]

تحرير تصنيف ألفا وبيتا

المصطلح "تصنيف ألفا"يستخدم بشكل أساسي اليوم للإشارة إلى مجال البحث عن الأصناف ووصفها وتسميتها ، لا سيما الأنواع. القرن التاسع عشر.

قدم ويليام بيرترام توريل مصطلح "تصنيف ألفا" في سلسلة من الأوراق المنشورة في عامي 1935 و 1937 ناقش فيها الفلسفة والتوجهات المستقبلية المحتملة لنظام التصنيف. [14]

. هناك رغبة متزايدة بين علماء التصنيف للنظر في مشاكلهم من وجهات نظر أوسع ، والتحقيق في إمكانيات توثيق التعاون مع زملائهم في علم الخلايا والإيكولوجيا والوراثة والاعتراف بأن بعض التنقيح أو التوسع ، ربما يكون ذا طبيعة جذرية ، لأهدافهم والطرق ، قد يكون مرغوبًا فيه. اقترح توريل (1935) أنه في الوقت الذي يتم فيه قبول التصنيف الأقدم الذي لا يقدر بثمن ، بناءً على البنية ، والمسمى "ألفا" بشكل ملائم ، فمن الممكن أن نلمح تصنيفًا بعيدًا مبنيًا على أوسع أساس ممكن من الحقائق المورفولوجية والفسيولوجية ، و واحد يوجد فيه "المكان لجميع البيانات الرصدية والتجريبية المتعلقة ، حتى ولو بشكل غير مباشر ، بتكوين الأنواع والمجموعات التصنيفية الأخرى ، والتقسيم الفرعي ، والأصل ، وسلوك الأنواع والمجموعات التصنيفية الأخرى". يمكن القول أن المثل العليا لا يمكن أن تتحقق بالكامل أبدًا. ومع ذلك ، فإن لها قيمة كبيرة في العمل كمحفزات دائمة ، وإذا كان لدينا بعض ، حتى الغموض ، المثالي لتصنيف "أوميغا" ، فقد نتقدم قليلاً إلى أسفل الأبجدية اليونانية. البعض منا يرضي أنفسنا من خلال التفكير في أننا نتلمس الآن تصنيفًا "تجريبيًا". [14]

وهكذا يستبعد توريل صراحةً من تصنيف ألفا مجالات الدراسة المختلفة التي يتضمنها ضمن التصنيف ككل ، مثل علم البيئة وعلم وظائف الأعضاء وعلم الوراثة وعلم الخلايا. كما استبعد إعادة البناء النشوء والتطور من تصنيف ألفا (ص 365 - 366).

استخدم المؤلفون اللاحقون المصطلح بمعنى مختلف ، ليعني ترسيم حدود الأنواع (وليس الأنواع الفرعية أو الأصناف من الرتب الأخرى) ، باستخدام أي تقنيات استقصائية متاحة ، بما في ذلك التقنيات الحسابية أو المختبرية المعقدة. [15] [12] وهكذا ، حدد إرنست ماير في عام 1968 "تصنيف بيتا"كتصنيف رتب أعلى من الأنواع. [16]

يعد فهم المعنى البيولوجي للتنوع والأصل التطوري لمجموعات الأنواع ذات الصلة أكثر أهمية بالنسبة للمرحلة الثانية من النشاط التصنيفي ، وفرز الأنواع في مجموعات من الأقارب ("الأصناف") وترتيبها في تسلسل هرمي فئات أعلى. هذا النشاط هو ما يشير إليه مصطلح التصنيف ويشار إليه أيضًا باسم "تصنيف بيتا".

Microtaxonomy و macrotaxonomy تحرير

كيف ينبغي تعريف الأنواع في مجموعة معينة من الكائنات الحية يثير مشاكل عملية ونظرية يشار إليها باسم مشكلة الأنواع. يُطلق على العمل العلمي لتقرير كيفية تحديد الأنواع اسم علم التحليل الدقيق. [17] [18] [12] بالامتداد ، علم التشريح الكلي هو دراسة المجموعات في الرتب التصنيفية الأعلى من الجنس الفرعي وما فوق. [12]

بينما تحاول بعض أوصاف التاريخ التصنيفي تحديد تاريخ التصنيف للحضارات القديمة ، إلا أن محاولة علمية حقيقية لتصنيف الكائنات الحية لم تحدث حتى القرن الثامن عشر. كانت الأعمال السابقة وصفية في المقام الأول وركزت على النباتات المفيدة في الزراعة أو الطب. هناك عدة مراحل في هذا التفكير العلمي. استند التصنيف المبكر إلى معايير عشوائية ، ما يسمى بـ "الأنظمة الاصطناعية" ، بما في ذلك نظام Linnaeus للتصنيف الجنسي للنباتات (بالطبع ، كان تصنيف Linnaeus للحيوانات بعنوان "Systema Naturae" ("نظام الطبيعة") ، مما يعني ضمناً أن هو ، على الأقل ، كان يعتقد أنه كان أكثر من مجرد "نظام مصطنع"). جاءت لاحقًا أنظمة تستند إلى دراسة أكثر شمولاً لخصائص الأصناف ، والتي يشار إليها باسم "الأنظمة الطبيعية" ، مثل أنظمة de Jussieu (1789) ، و de Candolle (1813) و Bentham and Hooker (1862–1863). وصفت هذه التصنيفات الأنماط التجريبية وكانت في مرحلة ما قبل التطور في التفكير. نشر تشارلز داروين حول أصل الأنواع (1859) أدى إلى تفسير جديد للتصنيفات على أساس العلاقات التطورية. كان هذا هو مفهوم أنظمة phyletic من عام 1883 فصاعدًا. تم تجسيد هذا النهج من خلال نهج Eichler (1883) و Engler (1886-1892). أدى ظهور المنهجية cladistic في السبعينيات إلى تصنيفات تستند إلى المعيار الوحيد للأحادية ، بدعم من وجود التشابك العصبي. منذ ذلك الحين ، تم توسيع أساس الأدلة ببيانات من علم الوراثة الجزيئية التي تكمل في معظمها التشكل التقليدي. [19] [ الصفحة المطلوبة ] [20] [ الصفحة المطلوبة ] [21] [ الصفحة المطلوبة ]

تحرير ما قبل ليني

علماء التصنيف الأوائل تحرير

من المحتمل أن تسمية وتصنيف محيطنا كان يحدث ما دامت البشرية قادرة على التواصل. كان من المهم دائمًا معرفة أسماء النباتات والحيوانات السامة والصالحة للأكل من أجل إيصال هذه المعلومات إلى أفراد الأسرة أو المجموعة الآخرين. تظهر الرسوم التوضيحية للنباتات الطبية في اللوحات الجدارية المصرية من ج. 1500 قبل الميلاد ، مما يشير إلى أن استخدامات الأنواع المختلفة كانت مفهومة وأن التصنيف الأساسي كان موجودًا. [22]

تحرير العصور القديمة

صنف أرسطو الكائنات الحية لأول مرة (اليونان ، 384-322 قبل الميلاد) أثناء إقامته في جزيرة ليسبوس. [23] [24] [25] وصنف الكائنات حسب أجزائها ، أو في المصطلحات الحديثة صفات، مثل الولادة الحية ، أو وجود أربع أرجل ، أو وضع البيض ، أو الدم ، أو الدفء. [26] قسم جميع الكائنات الحية إلى مجموعتين: نباتات وحيوانات. [24] بعض مجموعاته من الحيوانات مثل أنهايما (حيوانات بلا دم ، تُترجم إلى اللافقاريات) و Enhaima (الحيوانات ذات الدم ، الفقاريات تقريبًا) ، وكذلك مجموعات مثل أسماك القرش والحيتانيات ، لا تزال شائعة الاستخدام اليوم. [27] تابع تلميذه ثيوفراستوس (اليونان ، 370-285 قبل الميلاد) هذا التقليد ، وذكر حوالي 500 نبات واستخداماتها في كتابه هيستوريا بلانتاروم. مرة أخرى ، يمكن إرجاع العديد من مجموعات النباتات التي لا تزال معروفة حاليًا إلى ثيوفراستوس ، مثل كورنوس, زعفران، و نرجس. [24]

تحرير القرون الوسطى

استند التصنيف في العصور الوسطى إلى حد كبير على النظام الأرسطي ، [26] مع إضافات تتعلق بالترتيب الفلسفي والوجودي للمخلوقات. وشمل ذلك مفاهيم مثل السلسلة العظيمة للوجود في التقليد المدرسي الغربي ، [26] المشتق في النهاية من أرسطو. لم يصنف النظام الأرسطي النباتات أو الفطريات ، بسبب نقص المجاهر في ذلك الوقت ، [25] حيث كانت أفكاره قائمة على ترتيب العالم الكامل في سلسلة متصلة واحدة ، حسب scala naturae (السلم الطبيعي). [24] وهذا أيضًا تم أخذه بعين الاعتبار في سلسلة الوجود الكبرى. [24] تم إحراز تقدم من قبل علماء مثل بروكوبيوس ، وتيموثيوس من غزة ، وديمتريوس بيباجومينوس ، وتوما الأكويني. استخدم مفكرو العصور الوسطى التصنيفات الفلسفية والمنطقية المجردة التي تناسب الفلسفة المجردة أكثر من التصنيف العملي. [24]

عصر النهضة والتحرير الحديث المبكر

During the Renaissance and the Age of Enlightenment, categorizing organisms became more prevalent, [24] and taxonomic works became ambitious enough to replace the ancient texts. This is sometimes credited to the development of sophisticated optical lenses, which allowed the morphology of organisms to be studied in much greater detail. One of the earliest authors to take advantage of this leap in technology was the Italian physician Andrea Cesalpino (1519–1603), who has been called "the first taxonomist". [28] His magnum opus De Plantis came out in 1583, and described more than 1500 plant species. [29] [30] Two large plant families that he first recognized are still in use today: the Asteraceae and Brassicaceae. [31] Then in the 17th century John Ray (England, 1627–1705) wrote many important taxonomic works. [25] Arguably his greatest accomplishment was Methodus Plantarum Nova (1682), [32] in which he published details of over 18,000 plant species. At the time, his classifications were perhaps the most complex yet produced by any taxonomist, as he based his taxa on many combined characters. The next major taxonomic works were produced by Joseph Pitton de Tournefort (France, 1656–1708). [33] His work from 1700, Institutiones Rei Herbariae, included more than 9000 species in 698 genera, which directly influenced Linnaeus, as it was the text he used as a young student. [22]

The Linnaean era Edit

The Swedish botanist Carl Linnaeus (1707–1778) [26] ushered in a new era of taxonomy. With his major works Systema Naturae 1st Edition in 1735, [34] Species Plantarum in 1753, [35] and Systema Naturae 10th Edition, [36] he revolutionized modern taxonomy. His works implemented a standardized binomial naming system for animal and plant species, [37] which proved to be an elegant solution to a chaotic and disorganized taxonomic literature. He not only introduced the standard of class, order, genus, and species, but also made it possible to identify plants and animals from his book, by using the smaller parts of the flower. [37] Thus the Linnaean system was born, and is still used in essentially the same way today as it was in the 18th century. [37] Currently, plant and animal taxonomists regard Linnaeus' work as the "starting point" for valid names (at 1753 and 1758 respectively). [38] Names published before these dates are referred to as "pre-Linnaean", and not considered valid (with the exception of spiders published in Svenska Spindlar [39] ). Even taxonomic names published by Linnaeus himself before these dates are considered pre-Linnaean. [22]

A pattern of groups nested within groups was specified by Linnaeus' classifications of plants and animals, and these patterns began to be represented as dendrograms of the animal and plant kingdoms toward the end of the 18th century, well before حول أصل الأنواع was published. [25] The pattern of the "Natural System" did not entail a generating process, such as evolution, but may have implied it, inspiring early transmutationist thinkers . Among early works exploring the idea of a transmutation of species were Erasmus Darwin's 1796 Zoönomia and Jean-Baptiste Lamarck's فلسفة علم الحيوان of 1809. [12] The idea was popularized in the Anglophone world by the speculative but widely read Vestiges of the Natural History of Creation, published anonymously by Robert Chambers in 1844. [40]

With Darwin's theory, a general acceptance quickly appeared that a classification should reflect the Darwinian principle of common descent. [41] Tree of life representations became popular in scientific works, with known fossil groups incorporated. One of the first modern groups tied to fossil ancestors was birds. [42] Using the then newly discovered fossils of Archaeopteryx و هيسبيرورنيس, Thomas Henry Huxley pronounced that they had evolved from dinosaurs, a group formally named by Richard Owen in 1842. [43] [44] The resulting description, that of dinosaurs "giving rise to" or being "the ancestors of" birds, is the essential hallmark of evolutionary taxonomic thinking. As more and more fossil groups were found and recognized in the late 19th and early 20th centuries, palaeontologists worked to understand the history of animals through the ages by linking together known groups. [45] With the modern evolutionary synthesis of the early 1940s, an essentially modern understanding of the evolution of the major groups was in place. As evolutionary taxonomy is based on Linnaean taxonomic ranks, the two terms are largely interchangeable in modern use. [46]

The cladistic method has emerged since the 1960s. [41] In 1958, Julian Huxley used the term clade. [12] Later, in 1960, Cain and Harrison introduced the term cladistic. [12] The salient feature is arranging taxa in a hierarchical evolutionary tree, with the desideratum that all named taxa are monophyletic. [41] A taxon is called monophyletic if it includes all the descendants of an ancestral form. [47] [48] Groups that have descendant groups removed from them are termed paraphyletic, [47] while groups representing more than one branch from the tree of life are called polyphyletic. [47] [48] Monophyletic groups are recognized and diagnosed on the basis of synapomorphies, shared derived character states. [49]

Cladistic classifications are compatible with traditional Linnean taxonomy and the Codes of Zoological and Botanical Nomenclature. [50] An alternative system of nomenclature, the الكود الدولي لتسميات النشوء والتطور أو كود PhyloCode has been proposed, whose intent is to regulate the formal naming of clades. [51] [52] Linnaean ranks will be optional under the كود PhyloCode, which is intended to coexist with the current, rank-based codes. [52] It remains to be seen whether the systematic community will adopt the PhyloCode or reject it in favor of the current systems of nomenclature that have been employed (and modified as needed) for over 250 years.

Kingdoms and domains Edit

Well before Linnaeus, plants and animals were considered separate Kingdoms. [53] Linnaeus used this as the top rank, dividing the physical world into the vegetable, animal and mineral kingdoms. As advances in microscopy made classification of microorganisms possible, the number of kingdoms increased, five- and six-kingdom systems being the most common.

Domains are a relatively new grouping. First proposed in 1977, Carl Woese's three-domain system was not generally accepted until later. [54] One main characteristic of the three-domain method is the separation of Archaea and Bacteria, previously grouped into the single kingdom Bacteria (a kingdom also sometimes called Monera), [53] with the Eukaryota for all organisms whose cells contain a nucleus. [55] A small number of scientists include a sixth kingdom, Archaea, but do not accept the domain method. [53]

Thomas Cavalier-Smith, who published extensively on the classification of protists, recently [ عندما؟ ] proposed that the Neomura, the clade that groups together the Archaea and Eucarya, would have evolved from Bacteria, more precisely from Actinobacteria. His 2004 classification treated the archaeobacteria as part of a subkingdom of the kingdom Bacteria, i.e., he rejected the three-domain system entirely. [56] Stefan Luketa in 2012 proposed a five "dominion" system, adding Prionobiota (acellular and without nucleic acid) and Virusobiota (acellular but with nucleic acid) to the traditional three domains. [57]

Linnaeus
1735 [58]
هيكل
1866 [59]
Chatton
1925 [60]
Copeland
1938 [61]
Whittaker
1969 [62]
Woese et al.
1990 [63]
Cavalier-Smith
1998 [56]
Cavalier-Smith
2015 [64]
2 kingdoms 3 kingdoms 2 empires 4 kingdoms 5 kingdoms 3 domains 2 empires, 6 kingdoms 2 empires, 7 kingdoms
(not treated) الطلائعيات Prokaryota مونيرا مونيرا بكتيريا بكتيريا بكتيريا
العتيقة العتيقة
Eukaryota بروتوكتيستا الطلائعيات Eucarya الكائنات الاوليه الكائنات الاوليه
Chromista Chromista
Vegetabilia النبات النبات النبات النبات النبات
الفطريات الفطريات الفطريات
Animalia Animalia Animalia Animalia Animalia Animalia

Recent comprehensive classifications Edit

Partial classifications exist for many individual groups of organisms and are revised and replaced as new information becomes available however, comprehensive, published treatments of most or all life are rarer recent examples are that of Adl et al., 2012 and 2019, [65] [66] which covers eukaryotes only with an emphasis on protists, and Ruggiero et al., 2015, [67] covering both eukaryotes and prokaryotes to the rank of Order, although both exclude fossil representatives. [67] A separate compilation (Ruggiero, 2014) [68] covers extant taxa to the rank of family. Other, database-driven treatments include the Encyclopedia of Life, the Global Biodiversity Information Facility, the NCBI taxonomy database, the Interim Register of Marine and Nonmarine Genera, the Open Tree of Life, and the Catalogue of Life. The Paleobiology Database is a resource for fossils.

Biological taxonomy is a sub-discipline of biology, and is generally practiced by biologists known as "taxonomists", though enthusiastic naturalists are also frequently involved in the publication of new taxa. [69] Because taxonomy aims to describe and organize life, the work conducted by taxonomists is essential for the study of biodiversity and the resulting field of conservation biology. [70] [71]

Classifying organisms Edit

Biological classification is a critical component of the taxonomic process. As a result, it informs the user as to what the relatives of the taxon are hypothesized to be. Biological classification uses taxonomic ranks, including among others (in order from most inclusive to least inclusive): Domain, Kingdom, Phylum, Class, Order, Family, Genus, Species, and Strain. [72] [note 1]

Taxonomic descriptions Edit

The "definition" of a taxon is encapsulated by its description or its diagnosis or by both combined. There are no set rules governing the definition of taxa, but the naming and publication of new taxa is governed by sets of rules. [8] In zoology, the nomenclature for the more commonly used ranks (superfamily to subspecies), is regulated by the الكود الدولي لمصطلحات علم الحيوان (ICZN Code). [73] In the fields of phycology, mycology, and botany, the naming of taxa is governed by the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (ICN). [74]

The initial description of a taxon involves five main requirements: [75]

  1. The taxon must be given a name based on the 26 letters of the Latin alphabet (a binomial for new species, or uninomial for other ranks).
  2. The name must be unique (i.e. not a homonym).
  3. The description must be based on at least one name-bearing type specimen.
  4. It should include statements about appropriate attributes either to describe (define) the taxon or to differentiate it from other taxa (the diagnosis, ICZN Code, Article 13.1.1, ICN, Article 38). Both codes deliberately separate defining the content of a taxon (its circumscription) from defining its name.
  5. These first four requirements must be published in a work that is obtainable in numerous identical copies, as a permanent scientific record.

However, often much more information is included, like the geographic range of the taxon, ecological notes, chemistry, behavior, etc. How researchers arrive at their taxa varies: depending on the available data, and resources, methods vary from simple quantitative or qualitative comparisons of striking features, to elaborate computer analyses of large amounts of DNA sequence data. [76]

Author citation Edit

An "authority" may be placed after a scientific name. [77] The authority is the name of the scientist or scientists who first validly published the name. [77] For example, in 1758 Linnaeus gave the Asian elephant the scientific name إليفاس مكسيموس, so the name is sometimes written as "إليفاس مكسيموس Linnaeus, 1758". [78] The names of authors are frequently abbreviated: the abbreviation L., for Linnaeus, is commonly used. In botany, there is, in fact, a regulated list of standard abbreviations (see list of botanists by author abbreviation). [79] The system for assigning authorities differs slightly between botany and zoology. [8] However, it is standard that if the genus of a species has been changed since the original description, the original authority's name is placed in parentheses. [80]

In phenetics, also known as taximetrics, or numerical taxonomy, organisms are classified based on overall similarity, regardless of their phylogeny or evolutionary relationships. [12] It results in a measure of evolutionary "distance" between taxa. Phenetic methods have become relatively rare in modern times, largely superseded by cladistic analyses, as phenetic methods do not distinguish common ancestral (or plesiomorphic) traits from new common (or apomorphic) traits. [81] However, certain phenetic methods, such as neighbor joining, have found their way into cladistics, as a reasonable approximation of phylogeny when more advanced methods (such as Bayesian inference) are too computationally expensive. [82]

Modern taxonomy uses database technologies to search and catalogue classifications and their documentation. [83] While there is no commonly used database, there are comprehensive databases such as the كتالوج الحياة, which attempts to list every documented species. [84] The catalogue listed 1.64 million species for all kingdoms as of April 2016, claiming coverage of more than three quarters of the estimated species known to modern science. [85]


شاهد الفيديو: ماهي قواعد البيانات What is Data Base (يوليو 2022).


تعليقات:

  1. Jerrold

    أدركت بسرعة))))

  2. Gresham

    أنا أقبل ذلك بسرور. في رأيي ، هذا سؤال مثير للاهتمام ، سأشارك في المناقشة. أعلم أنه معا يمكننا الوصول إلى الإجابة الصحيحة.

  3. Matchitehew

    كما اتضح أنه لا عبثا =)

  4. Barhloew

    في رأيي ، إنه مخطئ. أنا متأكد. أقترح مناقشته. اكتب لي في رئيس الوزراء ، تحدث.

  5. Maccoll

    بالتاكيد. أنا متفق على كل ما سبق. يمكننا التواصل حول هذا الموضوع. هنا أو في PM.



اكتب رسالة