معلومة

شرح "استخدام النسخة التفاضلية" (DTU)

شرح



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

تصف هذه الورقة استخدام النسخ التفاضلية كـ

يعد استخدام النسخ التفاضلي (DTU) حالة خاصة من التضفير البديل حيث يختلف ملف وفرة النسخ النسبي للجين (RTA) ، ونسبة التعبير الكلي على مستوى الجين الذي ينشأ من كل من الأشكال الإسوية لنسخة الجين ، بين الظروف (Soneson et al. . ، 2016). [...] يمكن توضيح مثال على DTU من خلال السيناريو حيث يكون التعبير الجيني الإجمالي هو نفسه بين الشرطين A و B ، ولكن النسخة الإسوية 1 هي النسخة المعبر عنها في الغالب في الشرط A بينما النسخة الإسوية 2 هي النسخة المعبر عنها في الغالب في الحالة ب.

سؤالي هو: هل استخدام النسخة التفاضلية هو في الأساس نفس مستويات استخدام أكواد معينة؟ إذا لم يكن كذلك، ما هو الفرق؟ لست متأكدًا من "الأشكال الإسوية للنسخ" ، لذلك لست متأكدًا مما إذا كانت تتحدث عن الكودونات هنا أو عن شيء مختلف تمامًا.


لا ، إنه شيء مختلف تمامًا ، يتعلق بالربط والتضفير البديل.

أحيلك إلى بعض نصوص الوراثة للحصول على تفاصيل حول التضفير والتضفير البديل ، لكنني سأقدم هنا شرحًا موجزًا ​​وغير مكتمل لما هي عليه وكيف يتم إدخاله في DTU.

تتكون الجينات من إنترونات وإكسونات. الإكسونات هي الأجزاء الوحيدة الموجودة في الجينات عادة يؤلف النص الناضج (الاحتفاظ بالإنترون ممكن ، لكننا لسنا مهتمين بذلك). التضفير هو الآلية التي يتم من خلالها إزالة الإنترونات في الجين حقيقي النواة ، ويتم تجميع النسخة الناضجة فقط باستخدام exons. أثناء الربط ، لا يتم الاحتفاظ بالضرورة بكل exons. تخيل جينًا له exons 1 و 2 و 3. ومن الممكن أن يكون الشكل الرئيسي (يسمى شكل إسوي) هو الذي يتكون من exons 1 و 2 و 3. لنسمي ذلك Isoform 1. ومع ذلك ، بسبب ظاهرة تسمى الربط البديل، الأشكال الإسوية الأخرى ، يمكن أن تتولد ، على سبيل المثال شكل إسوي واحد مكون من exons 1 و 3. لنسمي ذلك Isoform 2. في المتوسط ​​، قد نتخيل أن وفرة Isoform 1 مقارنة ب Isoform 2 هو ثابت نوعا ما. ومع ذلك ، فإن بعض العلاجات أو بعض التغييرات في المحفزات البيئية ، يمكن أن تؤدي إلى أ استخدام النسخة التفاضلية التي تتغير بها الوفرة النسبية للاثنين من الأشكال الإسوية.


شاهد الفيديو: المعادلات التفاضلية المتجانسة (أغسطس 2022).